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生物科学专业同学们的交流空间

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    抑制LDHA活性会降低乳酸浓度并抑制α-MHC K1897乳酸化 据报道,LDHA可以调节细胞中乳酸的含量。Co-IP分析显示,抑制LDHA能减低α-MHC K1897的乳酸化(图1e-f)。心肌特敲LDHA后,K1897乳酰酸化降低(图1g)。类似地,LDHA抑制剂或Ang II处理减少了α-MHC K1897的乳酸化及α-MHC与Titin的相互作用;与单独使用Ang II治疗相比,当Ang II与LDHA抑制剂联合使用时,α-MHC K1897乳酸化和α-MHC-Titin的相互作用进一步降低(图1h-i)。 表明心力衰竭期间LDHA降低α-MHC K1897乳酸化。 图1 全
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    在环境条件(耐药)中,上游蛋白TRIM25的分子特征和调控机制 TRIM25在TMZ耐药中的分子状态发生了什么变化,从而影响了IPTKB蛋白积累? 探索:TRIM25磷酸化位点发生变化。研究表明翻译后修饰(如磷酸化)在调节Trim25活性中起重要作用。为了探究Trim25在初发和复发GBM中功能差异的原因,通过磷酸化蛋白质组学检测分析,结果发现Trim25的S100位点磷酸化在复发样本中显著降低(图1a-b)。体外泛素化实验检测,结果显示Trim25被ALP去磷酸化时,ITPKB泛素化显著减
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    第一步,SIRT1与α-MHC互作,降低α-MHC乳酸化水平 使用p300酰基转移酶激活剂干预未能完全挽救α-MHC K1897乳酸化以及α-MHC-Titin相互作用。为进一步阐明调控机制,确定α-MHC K1897相关的脱酰酶。Sirtuin家族蛋白是关键的脱酰酶,选择SIRT1–7作为脱乳酸化α-MHC的候选蛋白,发现只有SIRT1显著降低α-MHC乳酸化水平(图2a-b)。体内和体外Co-IP实验显示,SIRT1与α-MHC相互作用(图2c-d)。构建α-MHC不同截断体并进行Co-IP实验,发现α-MHC与SIRT1相互作用的结构域为mmCoA、MIT-
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    p300是α-MHC K1897 乳酸化的酰基转移酶 第一步,p300过表达显著上调α-MHC的乳酸化 研究显示p300可以作为酰基转移酶,催化组蛋白的乳酸化。体外和体内Co-IP实验发现p300与α-MHC相互作用(图1e-f)。另外,体外和体内Co-IP实验证实,p300激活剂可以增强α-MHC K1897的乳酸化,而p300抑制剂减弱α-MHC K1897的乳酸化(图1g-j)。此外,在心衰和心肌损伤中,Co-IP分析显示,无论是否有Ang II刺激,p300与α-MHC在H9c2细胞和小鼠心肌组织中均相互作用且没有显著变化(图1k-l)
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    TRIM25是一种泛素连接酶,是否参与调控ITPKB蛋白稳定性积累呢? 证据1:研究人员发现敲低Trim25,显著增加ITPKB蛋白积累;Trim25过表达则相反抑制其积累(图1a-b)。 证据2:加入蛋白酶体抑制剂MG132后,Trim25过表达诱导的ITPKB水平降低效应被逆转(图1c),表明Trim25通过蛋白酶体途径降低ITPKB的稳定性。 证据3:采用放线菌酮(CHX)追逐实验,发现Trim25敲低增加ITPKB蛋白的半衰期,Trim25过表达则相反(图1d-e)。 证据4:耐药细胞内源Co-IP分析显示Trim25敲低显著
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    TRPML1与ARL8B的结合是TRPML1介导的溶酶体胞吐和铁死亡抵抗所必需的 第一步,TRPML1与ARL8B互作 TRPML1过表达促进溶酶体在质膜上的对接和溶酶体胞吐。研究显示溶酶体通过与ARL8B和微管相关的激酶结合,从核周区转移到质膜。Co-IP分析显示TRPML1与ARL8B互作(图1d-e)。表明TRPML1可能通过与ARL8B结合,增强溶酶体向细胞膜的运动和溶酶体胞外分泌。 第二步,确定TRPML1与ARL8B互作的具体位置 为了找出TRPML1与ARL8B互作的具体位置。构建一系列ARL8B截断体,进行Co-IP实
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    如果我想研究人类基因,克隆,细胞体外培养,我要学生物工程,生物科学,生物科技的哪个。 还有我真的很想成为一名生物科学家。
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    TRIM25是一种泛素连接酶,是否参与调控ITPKB蛋白稳定性积累呢? 证据1:研究人员发现敲低Trim25,显著增加ITPKB蛋白积累;Trim25过表达则相反抑制其积累(图1a-b)。 证据2:加入蛋白酶体抑制剂MG132后,Trim25过表达诱导的ITPKB水平降低效应被逆转(图1c),表明Trim25通过蛋白酶体途径降低ITPKB的稳定性。 证据3:采用放线菌酮(CHX)追逐实验,发现Trim25敲低增加ITPKB蛋白的半衰期,Trim25过表达则相反(图1d-e)。 证据4:耐药细胞内源Co-IP分析显示Trim25敲低显著
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    探索1:调控水平确认。研究发现ITPKB蛋白(不是mRNA水平)在复发性组织和TMZ耐药细胞中显著上调(图1a-b),表明ITPKB蛋白的升高是转录后调控的结果。 探索2:互作泛素酶筛选。CoIP-MS分析发现泛素连接酶Trim25可能为候选互作蛋白(图1c)。调控蛋白积累的互作蛋白,优选泛素连接酶,读者朋友们可以借鉴。 验证1:CoIP验证。内源anti-Trim25 Co-IP实验证实Trim25与ITPKB的结合,与敏感细胞相比,在耐药细胞中相互作用更弱(图1d)。同时内源anti-Trim25 Co-IP实验
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    第一步,TRPML1是通过泛素蛋白酶体途径降解的 蛋白酶体抑制剂MG132以浓度依赖的方式增强TRPML1的蛋白丰度,而BafaA1对TRPML1没有影响,表明TRPML1是通过泛素蛋白酶体途径降解的(图1a)。 第二步,β-TrCP可能是TRPML1泛素化的主要E3连接酶 Co-IP实验显示,β-TrCP过表达上调TRPML1泛素化水平,β-TrCP ΔF的失活体则不能(图1c);此外,下调β-TrCP可降低TRPML1泛素化水平(图1d)。另外,Co-IP分析发现,K48R泛素突变体破坏了TRPML1的多泛素化,而K63R突变体则没有。此外
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    第一步,筛选调控TRPML的上游分子 为了确定癌细胞中调节溶酶体胞吐的上游途径,选了一个含有644种化合物的激酶抑制剂文库进行筛选(工作量有点大),结果发现:具有抑制功能的小分子大部分是PI3K和AKT抑制剂,其中AKT抑制剂对溶酶体胞吐的抑制作用最强,活化AKT的表达则增强癌细胞中溶酶体的胞吐(图1a-c)。 第二步,确定AKT是TRPML的上游分子 过表达AKT1增加TRPML1的蛋白丰度(图1e),敲减或抑制AKT则降低TRPML1的蛋白丰度(图1f);不影响TRPML1的mRN
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    生物科学是近几年发展起来的边沿学科,是社会科技发展的产物。虽然是新兴事物,可是它的出现和存在是科学发展的必然结果,也将在国家、社会的发展进步中起到举足轻重的作用。现在全国已经有一百多所高校设立了生物科学专业,像如中国科技大学和 北京大学等重要综合性大学,并且也提供了相应的进一步深造的机会。 国家、社会对这个专业是有需求的,也很重视,从这个发展趋势来看,这个专业的就业前景还是很可观的,但是,具体
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    课题组前期研究发现,催化多不饱和脂肪酸(PUFAs)氧合的12-脂氧合酶(ALOX12)是高水平ROS诱导的铁死亡应答的关键因子。在本研究中,PHLDA2是否通过ALOX12的ROS调控系统诱导铁死亡。 第一步,确定ROS铁死亡系统的相互作用分子 通过SFB标签抗体,进行IP-MS和IP-WB发现PHLDA2与ALOX12互作(图1a、b)。进一步通过内源抗体Co-IP双向验证PHLDA2与ALOX12存在相互作用(图1c-d)。而免疫荧光共定位实验发现PHLDA2和ALOX12能够同时共定位于细胞质(图1e),进一步佐证了PHLDA2-ALOX12
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    第一步,AARS1分别乳酸化YAP和TEADK90和K108位点 乳酸化蛋白质组学KEGG分析富集多种通路,重点集中在Hippo信号通路上,YAP和TEAD1分别在K90和K108位点发生了乳酸化(图1a-b)。IP-WB检测也显示YAP-TEAD发生乳酸化(图1c)。此外,构建YAP K90R和TEAD1 K108R突变体进行IP-WB检测显示没有发生乳酸化(图1d)。另外,葡萄糖剥夺降低YAP-TEAD1的乳酸化水平,而乳酸处理明显恢复其的乳酸化水平(图1e-f)。 第二步,AARS1与YAP-TEAD1相互作用 Co-IP实验发现AARS1与YAP-TEAD1互作(图1g
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    如题,我找了快两个小时了,还是没找到,只能求助,看文献知道有56个。
    羽溪2宝 10-11
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    之前的研究表明, PHGDH在肝癌中被过度激活,从而促进丝氨酸合成和维持氧化还原稳态。PRMT1的上调使PHGDH的过度活化,从而诱导PHGDH在第236位精氨酸的甲基化和随后的活化。鉴于FBXO7通过泛素介导的降解下调PRMT1,那么FBXO7是否降低PHGDH的甲基化和活性? 第一步,FBXO7通过下调PRMT1抑制PHGDH甲基化 IP-WB实验发现,发现FBXO7敲减显著提高PHGDH的甲基化水平,同时增加PRMT1的表达(图1f);相反,FBXO7高表达降低PHGDH甲基化水平和PRMT1的表达(图1g)。此外,IP-WB
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    我是生物专业的一名硕士,一言难尽,08年到23年,15年时间过去了,关于08年所说的就业问题依旧存在,一句21世纪是生物的世纪,哄骗了多少青年才俊涌入这个行业,但是却不出台相关政策支持,我们大学老师,大多是他们那个年代成绩最优秀的一批人,选择继续深造的,读了博士去高校当老师,没继续深造的也不知道现在在从事什么职业,我的建议就是逐渐缩少生物专业的招生,择优选择有兴趣的继续深造完成科研任务,不要再让更多懵懂少年再
    皮卡丘 10-7
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    作为一个生物科学本科今年刚毕业的人,来说一下自己的感想 出来半年还没找到稍微适合一点的工作,有苦说不出
    皮卡丘 10-7
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    我就是今年刚被生物科学专业录取的新生。在看了那么多关于这个专业的评论后,我并没有为自己的选择后悔苦恼。反而,我更加雄心勃勃。我知道中国现在的
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    第一步,探讨PRMT1在肝细胞癌中上调的机制 已有结果显示,PRMT1的蛋白水平在HCC中上调,但PRMT1 mRNA水平没有变化。推测泛素-蛋白酶体降解可能参与PRMT1的上调。用两种不同的蛋白酶体抑制剂处理细胞,发现PRMT1蛋白水平呈剂量依赖性增加(图1a),表明PRMT1的蛋白水平可以通过泛素介导的降解来调节。 第二步,确定PRMT1降解的关键泛素连接酶 根据设计的筛选策略,E3泛素连接酶FBXO7为候选互作蛋白(图1b-c)。IP-MS分析显示FBXO7是前10个与PRMT1相互作用的候
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    基于TCGA、GEO肺腺癌数据集,使用ssGSEA分析发现NSD3与糖酵解呈负相关(图1a)。过表达或敲除NSD3发现,NSD3抑制糖酵解酶(图1b-c)。此外,NSD3能抑制乳酸生成和葡萄糖消耗(图1d-g)。进一步挽救实验表明NSD3通过抑制HK2来抑制LUAD的糖酵解(图1h-i)。 更多详细内容分享请查阅:【《Adv Sci》老树新花:组蛋白甲基转移酶的非表观功能!NSD3在抑制肺腺癌糖酵解中的作用机理】。 如有相关机制研究,包括免疫沉淀试验(IP、RIP、CHIP、CHIRP)和蛋白组芯片检测
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    第一步,初步确定OTUD5潜在的底物蛋白 作为去泛素化酶(DUB),OTUD5通过去泛素化底物蛋白起作用。利用IP-MS鉴定潜在的互作蛋白(图1a)。质谱鉴定的前15个潜在结合蛋白中,TAK1被证实在足细胞炎症和DKD进展中具有关键的调节作用(图1b)。因此,假设OTUD5通过去泛素化TAK1在足细胞中负调控炎症和损伤。 第二步,确定TAK1与OTUD5相互作用 内源性Co-IP实验证实,OTUD5与TAK1在细胞和小鼠肾组织均存在相互作用(图1c-d)。同时,外源性Co-IP实验也显示,OTUD5与T
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    糖尿病肾病(DKD)是一种普遍存在的慢性肾脏疾病,是终末期肾病进展的主要原因。足细胞是覆盖GBM外表面的高度分化的上皮细胞,对于维持GBM的完整性至关重要。因此,足细胞损伤的程度通常用来评估DKD的进展。此外,足细胞中的炎症积聚与足细胞损伤的加重密切相关。 2024年6月,温州医科大学梁广团队在Nat Commun(IF=14.7)上,发表“Podocyte OTUD5 alleviates diabetic kidney disease through deubiquitinating TAK1 and reducing podocyte inflammation and injury”的研究成果。揭示
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    AARS1作为一种蛋白质乳酸转移酶,使用乳酸作为直接的乳酸供体 第一步,AARS1与乳酸存在结合 分子对接预测乳酸可以很容易地结合到AARS1的催化口袋上(图1a)。等温滴定量热法验证了该结果(图1b)。 第二步,确定AARS1是一种乳酸转移酶 体外乳酸化实验,显示AARS1能够以依赖于乳酸和ATP的方式直接使组蛋白H3和H4乳酸化(图1c);质谱分析,显示AARS1能直接在K18处乳酸化H3肽(图1d)。AARS1催化袋内氨基酸残基突变体(5M)消除了其乳酸转移酶活性(图1c-d
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    UBE2C促进SNAT2的单泛素修饰,抑制其多泛素修饰。 检测步骤: 第一步,筛选UBE2C蛋白底物SNAT2 IP-MS和泛素蛋白质组学检测发现:SNAT2是UBE2C泛素修饰的底物(图1a)。 第二步,UBE2C与SNAT2相互作用 Co-IP等实验检测证实UBE2C与SNAT2相互作用(图1 b-c)。 第三步,发现UBE2C促进SNAT2的单泛素化,阻断K63连接的泛素链的延伸 Co-IP分析显示发现UBE2C促进SNAT2的单泛素化,但阻断了泛素链的延伸(图1 d-e)。分别构建不同泛素突变体Ub-WT,K6R,K11R,K 27R, K29R, K33R,K48R,K63R(基
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    使用HA-Ub-WT/KO泛素修饰系统检测修饰类型:使用HA-Ub-WT和HA-Ub-KO(K6,K11,K27,K29,K33,K48和K63)载体,分别与泛素连接酶(E3)和修饰底物共转染细胞,通过CoIP-WB检测底物泛素化水平,明确泛素连接酶对修饰底物的泛素修饰类型。或再次使用HA-Ub-WT(K6R,K11R,K27R,K29R,K33R,K48R和K63R)载体,分别与泛素连接酶(E3)和修饰底物共转染细胞,通过CoIP-WB检测底物泛素化水平,再次明确泛素连接酶对修饰底物的泛素修饰类型。 使用靶蛋白修饰位点突变鉴定
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    ChIP-Seq检测和ChIP-qPCR验证要点: (1)实验设计:尽量进行实验组别设计和生物学重复检测,提高后续验证的阳性率。常规过表达单组(Ab IP vs IgG IP);动态互作组学(实验组vs对照组vs IgG组)。根据目的设计适当的生物学重复。如果后续以ChIP-Seq数据进行互作组标准分析,则需要3-4组生物学重复;如果后续以寻找关键互作DNA片段,进行深入的机制研究,则建议1-2次生物学重复。根据经验,单次重复假阳性率达90%。ChIP-Seq强烈建议设置实验组别和生物学
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    简牍:疾病靶点泛素修饰调控机制研究思路。 Step1:根据临床需求和文献,凝练临床科学问题。 Step2:根据临床科学问题,确定泛素修饰靶点。 Step3:明确修饰靶点的细胞动物模型功能 Step4:解析泛素修饰酶,修饰类型和位点、以及下游机制分子调控方式等。 该研究为病理提供新视角、为诊疗提供新策略。 正文: 互作机制研究是临床基础研究的难点,修饰互作机制研究是互作机制研究上的明珠。泛素化修饰机制研究,主要目标是深入理解泛素化过程
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    淋巴结(LN)转移是大多数实体瘤的主要转移途径,并促进远处转移。研究表明,淋巴管生成在促进淋巴结转移中起着关键作用。因此,研究淋巴管生成的调控机制,对于防止肿瘤转移到LNs并随后发生远处扩散具有重要的临床意义。 2024年7月,中山大学附属中山纪念医院团队在J Clin Invest(IF=13.3)上,发表“UBE2C-induced crosstalk between mono- and polyubiquitination of SNAT2 promotes lymphatic metastasis in bladder cancer”的研究成果,揭示了UBE2C促进膀胱癌转移的机制,并将UBE2C
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    新大一求问 录到了师范类的生物科学,以后考研啊之类的和普通的生物科学有区别吗,是会限制一点吗
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    去了双非二本生科还是中外合办 有没有学长学姐给点建议 考研是应该往南方考还是在东北呢 这个专业就业的话除了老师还有什么啊 薪资怎么样
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    穗基云盟-质粒共享1.0版 云盟质粒初始库: 人cDNA细菌文库:29177个克隆,覆盖16654个基因。 蛋白表达质粒库:细菌/酵母/哺乳系统表达质粒,若干。 瞬时表达质粒库:pCDNA等系列目的载体,若干。 慢病毒质粒库:过表达/敲减/敲除目的质粒,若干。 更多精彩细节,欢迎留言探讨。 云盟愿景:共享质粒,促进繁荣。
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    只能干老师吗,看网上好像可以做质检医药啥的,考研难吗,考公竞争大吗选择多吗
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    三阴性乳腺癌(TNBC)是乳腺癌中最恶性的亚型。TP53突变是肿瘤常见的抑癌转促癌突变。在TNBC患者中,TP53突变率高达80%,其突变会导致化疗耐药或免疫治疗效果差等临床问题。因此,迫切需要阐明分子机制并确定TNBC进展的新靶点。 2024年7月,山东大学杨其峰团队在Adv Sci(IF=14.3)上,发表“CircCFL1 Promotes TNBC Stemness and Immunoescape via Deacetylation-Mediated c-Myc Deubiquitylation to Facilitate Mutant TP53 Transcription”的研究成果,提示了TNBC中突变TP53调控的新机制,并为TNB
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    鼻咽癌(NPC)是一种影响头颈部的癌症。目前,化疗是局部晚期鼻咽癌(LA-NPC)患者的标准方案。然而,约10%的鼻咽癌患者出现化疗耐药,导致预后不理想。因此,阐明化疗耐药的分子机制至关重要。 2024年7月,中山大学唐玲珑和赵银团队在Adv Sci(IF=14.3)上,发表“DCAF7 Acts as A Scaffold to Recruit USP10 for G3BP1 Deubiquitylation and Facilitates Chemoresistance and Metastasis in Nasopharyngeal Carcinoma”的研究成果,发现DCAF7在体外和体内促进鼻咽癌细胞的顺铂耐药和转移。 图
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    基于HuProt蛋白组芯片筛选目的蛋白的互作蛋白技术服务蛋白组芯片是一种蛋白组通量的蛋白芯片工具,可以对目标样本进行蛋白组通量水平的结合蛋白谱检测和评价。HuProtTM v4.0蛋白芯片是目前世界上包含更大蛋白库的蛋白组芯片产品。HuProtTM v4.0蛋白芯片包含>21000个蛋白,覆盖人蛋白组81%的蛋白。样本中的小分子化合物与蛋白芯片上的蛋白通过特异性结合作用,从而识别目的小分子的互作蛋白特征谱,用于研究小分子的相互作用网络,识别小分子的
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    家里有小孩今年高考,理科,对生物有兴趣,想了解就业? 有一个叫“生物技术”的专业,和生物科学,比较接近吧? 主要去哪些类型的公司呢?从事什么岗位呢? 具体不太懂,知道的亲来解答下
    蜀黍158 7-18
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    乳酸丰富是肿瘤的结果,肿瘤即使在含氧量正常的情况下,也会利用糖酵解作为能量代谢的主要来源,这种Warburg效应,促使肿瘤细胞具有丰富的乳酸代谢特征。存在即合理,肿瘤乳酸的促癌机制,是肿瘤靶点开发的重要内容。 2024年3月,同济大学、复旦大学及安徽科技大学等多单位合作在J Clin Invest(IF=13.3)上,发表“The alanyl-tRNA synthetase AARS1 moonlights as a lactyltransferase to promote YAP signaling in gastric cancer”的研究成果,研究发现tRNA合成酶丙氨酰-tRNA合成
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    出四川大学考研生物656.939资料,考研英语+政治需要的可以联系我#考研#
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    研究表明免疫治疗或放疗可诱导肿瘤细胞铁死亡;相反,铁死亡可促进肿瘤治疗的效果。靶向诱导铁死亡是极具 潜力的肿瘤治疗方式。 2024 年 6 月,中山大学肿瘤防治中心邓蓉、朱孝峰团队在Science Translational Medicine(IF=15.8)上,发表“TRPML1 triggers ferroptosis defense and is a potential therapeutic target in AKT-hyperactivated cancer”的研究成果,揭示了TRPML1-ARL8B 介导的溶酶体胞吐通过抵抗铁死亡,促进 AKT 驱动的肿瘤发生和治疗耐受。 图形摘要: Highlights如下: 1)筛
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    高考被录到生物科学了打算读博,今年的新大一,想问一问前景怎么样,都说生物不好,具体的想征求一下行内人的意见。
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    看网上说读研去做研究不太够要读博是真的吗
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    样品制备、电泳、转膜、封闭、一抗、二抗、显色 一、蛋白准备(样品制备) (一)总蛋白提取(弱的RIPA裂解液或WB裂解液)1.方法一(胰酶消化):去除细胞上清培养基,PBS清洗1-2次,加入适量胰酶消化,放置37℃,5%CO2培养箱中(不同细胞消化时间不同),消化完全,2倍于胰酶体积的完全培养基终止反应,吹散混匀,吸入至15 mL 离心管,1000-1500 rpm,离心3-5 min。 2.方法二(用细胞刮将细胞刮下):留1-2 mL细胞上清培养基,将培养皿放置冰上用细胞刮
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    肝癌细胞富含脂滴是该癌种的显著特征。肝癌细胞由于快速增殖,需要动员储存在脂滴中的脂质,通过线粒体脂肪酸氧化磷酸化来产生能量,以满足其快速增殖的需求。然而,肿瘤细胞如何调节脂滴与线粒体的相互作用目前尚不明确。 2024年5月,浙江大学转化医学研究院/浙江大学医学院附属第一医院/国家基础科学中心/浙江大学基础交叉研究院吕志民教授/许大千研究员团队在Nature Metabolism上,发表“Glycolytic enzyme PFKL governs lipolysis by promoting lipid droplet
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    好难背 好难记 期末周。。。好累(๑ó﹏ò๑)

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