小说中的《双塔奇谋》开始于阿拉贡等人和半兽人之间的战斗，不过为了保证电影第一部的精采，这部分故事被彼得·杰克逊给放到《护戒使者》的结尾部分去了。
电影中梅里和皮聘被人追着逃进了法贡森林而为树胡所救，但事实上小说部分树胡只是遇见了他们，而并没有救他们。我怀疑以树人的慢性子，在救人的时候会不会那么当机立断，说不定还要开个会决定一下呢。彼得·杰克逊的改编很显示是为了增加影片的戏剧性。而后，托尔金对树人们进行了很长的描写，这部分在小说里有两个章节的长度，不过很显然，彼得·杰克逊觉得把这些东西都放进去太冗长了，所以只用几个画面就交待了。书中那个急性子的树人“疾如风”在电影里不知道是哪个。
小说中，洛汗国的骠骑将军伊欧墨的出场是戏剧性的，在灰盔骨战争最吃紧的时候，他和甘道夫带着一骠人马加入战团，并确保了战争的胜利。但小说中可不是这个样子，伊欧墨早早就带着人回到了希优顿国王的身边，并和他们一起在圣盔谷中作战。
电影里有这样一幕：希优顿下令所有居民都退去圣盔谷碉堡，这一幕总是让我联想起三国志。但其实托尔金的原意是希优顿带着骑士们去圣盔谷和敌人交战，而不是老弱病残都带上的奔命，这时候伊欧玟公主领导着洛汗的人民依然呆在王都里呢，当然，平原上和敌人作战的戏也是原著里没有的喽。彼得·杰克逊的改编突出了战局的紧张，另外一点就是拉住了伊欧玟和阿拉贡的一条感情线。
看到电影中瑞文戴尔精灵部队的增援大家一定觉得很激动吧？这是圣盔谷之幸，不过小说中的圣盔谷战士就不幸多了：没有人来增援他们。彼得·杰克逊为了突出大战的气氛，又把一方的战士卷入了战火。
小说中的《双城奇谋》中有一段描写了萨鲁曼被困在塔里和众人见面的情节，不过电影版里就没有交待了，只在加长版里给了一个他和巧言在塔上张望的镜头。
《指环王最终曲》：作为整个系列的终结，本片也为整个《指环王》剧组赢来了早该属于他们的荣誉。作为整部《指环王》的结束，本作当然也会给一直期待差它到来的终实影迷一个满意的交待：在《双塔奇谋》上映后，有很多观众抱怨电影少了一场很重要的戏：佛罗多和山姆遇上大蜘蛛，后来官方放了消息，说这部分戏并没有被剪掉，而是被安排到了《国王归来》里边。原因是一部电影不能有两个高潮，圣盔谷一场大战激起了人们的神经，观众心还没放下来如果又来一场佛罗多、山姆斗蜘蛛，一定会冲淡影片的效果的。
原著的第三部中在甘道夫和皮聘在米那斯提力斯的同时，阿拉贡和希优顿国王正从依森哈德返回洛汗国，此处有一个场景没有在电影第三部中反应出来。阿拉贡在途中遇到了一队神秘的骑士，他们来自北方，是阿拉贡的部下，同时他们还带来了亚纹公主给阿拉贡的礼物，以及爱隆的两个儿子。在这个时候，阿拉贡在夜晚观看了从萨鲁曼处拿来的晶石，凭借自己的意志和索伦对话，并展现了人类的实力去威慑黑暗魔王。同时他也决定去亡者之道寻求远古以来的那只军队。电影中把情节做了较大的改动。爱隆王亲自出马和阿拉贡相见，并奉上了已经重新修筑完成的人皇之剑（其实小说中在第一部中就已经修复好了这把剑）以及亚纹的话。
帕兰诺平原保卫战是小说和电影中都表现的一个宏大场景。但是看过电影之后，再来看小说，总觉得小说描写的大部分都是众生相，具体的个相表现的非常少。而电影中，精灵莱苟拉斯大战异象这个场景充分展现了大战中每个人的表现。而且在伊欧纹与戒灵之王的交战中的细节处理，电影也与小说有所差别。
还有一个差别就是亡灵部队，记得看预告片的时候印象最深的就是阿拉贡手持圣剑，带领着一群看上去若有若无的亡灵部队奋力杀敌。而事实上，小说中这批亡灵部队并未参与帕兰诺平原保卫战，他们只是帮助阿拉贡夺取了很多战舰，给了兽人部队一个突如其来的袭击。
小哈比特人踏上了回家的旅途，不过和电影中一下子到家不同的是，他们在小说中还去依森哈德拜访了树胡老爷爷，现在的依森哈德已经成了一个大花园。然后他们又去了洛汗国，见证了法拉墨和伊欧纹一段好姻缘，从洛汗国出来的途中遇到了落魄的萨鲁曼和巧言。离开夏尔一年后，他们重回跃马酒店，到了那儿也意味着他们越来越靠近家乡了。可是回家了，却发现当地被一群恶棍占领着。这四个小哈比特人就组织当地的人一起反抗，结果到最后竟然发现幕后指使竟然就是萨鲁曼。不过佛罗多好心放萨鲁曼走了，但是他还用刀刺佛罗多，不过没有成功。没想到的是，萨鲁曼最后竟然死于巧言之手。
原著中写到了山姆送佛罗多远去西方世界，回到家说了句：我回来了。就结束了。而电影却煽情地用了差不多20分钟交代了里面所有人的最终结果，山姆做了夏尔的市长，梅里、皮聘和阿拉贡葬在了一起，金雳和莱苟拉斯一起也去往西方世界。让这个三部曲有了一个非常完满的结局。
