位于海淀镇东侧皇庄，始建于明代，清代乾隆三十八年(1773年)重修，清代道光二十六年(1846年)增建灶君殿，清同治年间又加修葺。清末民初，这里每庙阴历四月初一至十五有药市，庙市十分热闹，民间有“药王庙进香——自讨苦吃”的歇后语，以记其况。
　　寺院坐北朝南，山门殿三间，硬山箍头脊面积49平方米，明间有石券门，两边次间为菱花石券窗。进入山门即药王殿三楹，内供泥塑彩绘药王像，硬山箍头脊；再后为观音殿三楹硬山挑大脊，面积49平方米；第三进大殿三楹硬山箍头脊，面积70平方米。最后为灶君殿三楹：中楹供灶君，左楹为客堂，右楹为司房。殿前有月台一座。
　　庙内有乾隆三十八年(1773年)所立《重修海淀药王庙碑记》，大学士于敏中撰文，碑镶嵌在殿西墙；有清道光二十六年(1846年)海淀各坊向内外旗民茶厨两行人等公立《增建灶君殿碑记》两块，碑石移至石刻博物馆收藏。
　　1928年北平市特别政府社会局庙宇登记时庙的面积为4亩7分4厘，有房51间，香火地24亩。法物有大小神像21尊：木质8位，铜质10位，泥质3位，大铁钟1口，小铁钟1口，木梆一架，木鱼两个，铁鼎一座，供桌4张，木五供一堂，铁蜡扦一个，木龛2个，藏经一部，另有旗杆2根。
　　1936年北平市政府庙宇登记时，庙的面积约10亩余，房屋22间，附属房基地55亩。管理使用状况为供佛或自住，香火地出租。法物有佛像4尊，神像3尊，礼器3件，法器3件。另有大小松槐榆20余棵。
　　解放前夕该庙主持为乔林和尚、王增洲老道，据云二位都是大军阀吴佩孚的旧属下，失意后寄庙栖身。解放初期政府将二人安排到小学校当工友，庙产归公，初为*****驻地，后又辟为海淀百货公司医药批发站。1991年扩建百颐路时被毁无存。