投入最少的成本就可以得到更大的收益，因为只需非常小的一块地方就可以收获非常多的藻类。美国旧金山地区海洋技术和环境咨询协会（OceanTechnology&EnvironmentalConsulting）的首席执行官估计，用藻类生物柴油替换掉美国现在耗费的柴油，大约只用到现在生产用地的0.5%。藻类在贫瘠的土地上也能生长，诸如在地下水咸涩的沙漠地区。
但是为藻类创造最佳的环境是困难和昂贵的。开放式池塘常常寄生了大量其他物种，其中包括入侵物种，而且温度平衡的需要、光照水平、流动循环和其他因素都会 使费用快速升高。依照世界观察研究所最近一份关于生物燃料的报告，在近期，只有在发电厂附近栽培藻类制造燃料才可能是比较经济的，藻类在那里也可以吸收污染。美国马萨诸塞州的一家公司GreenFuelTechnologies正在美国亚利桑那州、路易斯安那州和德国建造这样的系统，他们期望它差不多能够捕获电厂白天所排放的二氧化碳的80%。