后金并没有理会虎墩兔憨的警告，出兵攻占了广宁。广宁之战时，明巡抚“王化贞以二万金抚炒花五大营、虎墩八大营，歹青二千人，许助兵攻建州......化贞持西人为援，锐言战以挠廷弼。西人卒不至，河西尽没，化贞论死”[10]似乎明朝联合蒙古灭金并没有收到预期的效果，但事实并非如此，蒙古某些部落的确有出兵援助明军，据《明史纪事本未补编·西人封贡》记载：“建人入广宁，参将祖大寿借暧兔、贵英二万骑，却建人于宁远城北双树子。”
更重要的是，后金军攻克广宁，不敢乘胜进军山海关，显然是受到了蒙古诸部的牵制。据天启二年六月经略王在晋向明帝疏报：“有李世英、刘承功等自广宁滴水寺逃回等，距城十里，夜望城头灯火达旦，以防西虏之掩袭，贼之不攻关者惧虏也，非惧虏之强，惧虏之众，招呼其部落也。又有乐清人王国，自辽阳苏胡子堡逃回，知奴住新城，李永芳住辽阳，奴发兵一技守镇江防朝鲜，发兵一技守南卫防登莱，发兵一技守广宁防西虏。”[11]
对于蒙古的掣肘，努儿哈赤也一直耿耿于怀。他曾经说：“满洲苟无城郭，蒙古岂令我等安居哉！”[12](这时已叫满洲了?)的确如此，努儿哈赤多次迁都可以证明他对蒙古的重视。努儿哈赤迁都辽阳时即认为辽阳美中不足：“辽阳城头大，且多年顷圮，东南有朝鲜，西北有蒙古，二国俱未服，若释此而征大明，难免内顾之忧，必另筑城郭，派兵坚守，庶得坦然前驱，而无后虑矣。”[13]四年以后迁都沈阳，努儿哈赤认为沈阳是战略要地：“北征蒙古，二三日可至。”[14]努儿哈赤这些年的言论反映了现实中蒙古对后金巨大的威胁。
天启六年，努儿哈赤抓住辽东经略高第把关外一些部队撤入关内的失误，进攻宁远。没料到被坚守宁远的明将袁崇焕用红夷大炮击败，不得不撤回老巢。后来清人修《明史》称：“修我满清举兵，所向无不摧破，诸将罔敢议战守。议战守，自崇焕始。”[15]
宁远之战后不久，后金汗努儿哈赤死去，黄太机接位。
后金因为与明朝开战，人参、貂皮等特产失去了传统市场，遭到了明朝的经济封锁，更兼有蒙古某些部落及朝鲜在旁掣肘，这时后金又发生饥荒，一时陷入困境。
