Seit 1994 unterliegt die Aufsicht der Aktivitäten des SIS einem Ausschuss des Parlaments.

Hauptsitz des MI6 bei Vauxhall Cross, Vauxhall, London Seit 1995 befindet sich das Hauptquartier am Vauxhall Cross, an der Themse in London. Der ehemalige Leiter der Behörde (2004 bis 2009) John Scarlett war durch die Gerichtsverhandlung über den Selbstmord von David Kelly in den britischen Medien sehr präsent und war Führungsoffizier von Oleg Gordiewski dessen Flucht er 1985 auch organisierte.[3] Seit dem 13. Oktober 2005 besitzt der SIS eine eigene Website. Ende Dezember 2007 berichtet der russische Inlandsgeheimdienst FSB, dass der MI6 den ehemaligen russischen Geheimdienstler Wjatscheslaw Scharkow angeworben und mit der Beschaffung von Geheimdaten beauftragt hat. Scharkow habe sich allerdings im Juni 2007 freiwillig dem FSB gestellt und vier weitere MI6-Agenten entlarvt.