一般得到基因敲除小鼠后，首先要做的就是小鼠基因型的鉴定，一般采用PCR的方式。
获得的基因敲除小鼠种类不一样，所以采用的引物也不一样，比如我们做的全基因敲除小鼠，用neo抗性基因取代了小鼠本身的一段基因序列，这时我们一般在取代基因的位置选一对引物（引物1），在neo前选一个正向引物，反向引物在neo上选取（引物2），那么通过2次PCR的方式，野生型小鼠只能用引物1扩增出单一条带，而全敲除小鼠只能用引物2扩增出相应大小的片段，杂合子小鼠是引物1和引物2都可以扩增出相应大小的片段。
获得的基因敲除小鼠种类不一样，所以采用的引物也不一样，比如我们做的全基因敲除小鼠，用neo抗性基因取代了小鼠本身的一段基因序列，这时我们一般在取代基因的位置选一对引物（引物1），在neo前选一个正向引物，反向引物在neo上选取（引物2），那么通过2次PCR的方式，野生型小鼠只能用引物1扩增出单一条带，而全敲除小鼠只能用引物2扩增出相应大小的片段，杂合子小鼠是引物1和引物2都可以扩增出相应大小的片段。
