根据这份报告，2012年度透明指数排名前五位的公益慈善组织依次为:南都公益基金会、上海真爱梦想公益基金会、中国残疾人福利基金会、安利公益基金会和中华思源工程扶贫基金会。中国红十字基金会透明指数居第8位，中国红十字会总会排名第32位。
　　报告指出，2012年，政府对慈善机构的监管空前加强，慈善行业透明化建设提速，公共信息平台建设有所推进。
　　民政部社会福利与慈善事业促进司副司长徐建中表示，民政部正在起草关于加快慈善事业发展的意见，将对公益慈善组织的透明状况提出进一步要求。
　　公众满意度相对提升
　　同时，报告还显示，2012年公众对慈善组织信息公开状况的满意度有所提升，表示满意和一般满意的比例为39%。
　　根据一项以网络问卷形式进行的公众调查，2012年对慈善信息公开状况表示不满意的公众比例为61%，而2011年，这一比例是92%。

中民慈善捐助信息中心副主任刘佑平表示，61%的反馈信息表示对慈善信息公开状况不满意，说明公众对慈善行业信息公开有着很高的期待。
　　刘佑平说，在2011年的调查中，公众最希望了解的是财务信息，而今年关注焦点转向了慈善组织的业务信息，这表明公众已经不是简单质疑公益善款的来源去向，而是关注公益慈善组织的具体工作内容，希望了解它们在做什么和怎么做。

面临三大挑战
　　这份由中民慈善捐助信息中心发布的第四份年度慈善透明报告指出，当前，公益慈善行业主要面临三大挑战，一是公益慈善信息公开的权威标准依旧缺乏、信息公开奖惩机制执行不力；二是慈善组织间透明化程度差距加大、信息化成本高昂，重复建设严重；三是公众对公益慈善的关注更专业，慈善组织信息公开与公众信息接收之间存在鸿沟。
　　报告建议政府建立统一的慈善信息公开标准及奖惩机制，搭建公益慈善行业信息公开平台，同时，在慈善行业建立透明自律联盟，形成政府、行业、媒体与社会公众的多层次慈善透明监管体，为公益慈善行业建起一道立体防火墙。