熊耳山横亘县境中部，使县内河流分别属黄河、长江两大水域。熊耳山以北，主要是县川盆地的洛河水系，西段为近东西走向，至龙驹变为北东走向，两岸支流交互汇入。东北部的杜关河先由西向东，再折北入灵宝的弘农河而入黄河。熊耳山以南主要有老鹳河、淇河，基本为东南走向，南流入丹江。全县水资源总量8.9亿立方米。（1） 洛河：洛河发源于陕西省洛南县洛源乡木岔沟，从河口街入卢氏县境，贯于崤山、熊耳山之间，经山河口入洛宁县到巩义入黄河，卢氏境内流长113公里，流域面积2425平方公里，年总径流量5.29亿立方米，为县境内第一大河流。县境内的水能蕴藏量84200千瓦。
洛河的主要支流有兰草河、索峪河、官坡河、潘河、沙河、横涧河、卜象河、文峪河、秦家河、范里河和寻峪河等。（2） 老鹳河：发源于栾川县冷水镇小庙岭，从马驹口入县境，向西南温口与五里川支流汇合，向东南流经朱阳关分别出县境，过西峡至淅川县汇入丹江口水库，年经流量1.58万立方米，境内流长57.5公里，流域面积589平方公里。境内主要支流有五里川河、小沟河、涧北沟、衙玉沟等 。（3） 淇河：发源于狮子坪乡大阴壕，至瓦窑沟乡的碾子湾出县境，经西峡汇入丹江，境内流长60.1公里，年经流量1.33亿立方米，比降 1/400 米，境内流域面积494平方公里，境内主要支流有黄柏沟河，观沟河、瓦窑沟河、明朗河、毛河等。老鹳河、淇河的共同特点是落差大，水流急，弯曲度大，峡谷河段长，支流多，水量充沛，水力资源丰富。（4）地下水卢氏境内主要含水岩系有碳酸盐岩系和碎屑类岩组，属中等富水含岩组。以溶滤作用为主，水质较好。县西部的基岩山区，沟谷切割，地形起伏，基岩裸露，岩溶十分发达，能大量接受降水渗入补给，西南山区地下水一般比较充足。横涧、杜关河谷平川"掘地三尺便是井"；县川洛河两岸均能凿机井提灌，四周丘陵区的冲沟中均有小泉眼和滤出小溪水源。汤河乡有温泉，可治疗多种疾病。