暴风城刺客团把自己看作是一只握住匕首的手，整个组织由此被分成五个分支。马迪亚斯·肖尔和他的领导层是拇指，负责管理和领导。领导层由大约30名资深的盗贼组成，他们中的大多数都认识帕索妮亚，有些人还直接受过她的领导。他们对帕索妮亚所希望的组织发展方向十分了解，并经常指引年轻的马迪亚斯走上正确的道路。其他的领导者们则负责剩下的四根手指，领导、训练、记录，甚至管理簿册以及确认工资发到了每个人手上。这只手的另两个手指是由组织中最高等级的成员组成的，各有约500名盗贼。食指，一个刺客在放弃人生进入拇指级的领导层之前能够达到的最高等级，投身于暗杀活动，从敌对的军事领袖到腐败的牧师，暗杀的目标可以是任何人。中指，则负责材料的“获取”，夺回一件已经被盗窃的物品，将其归还给正当的主人，或是从某个不太方便直接杀死的政要手中获取某样强力的物品。组成无名指的约500名盗贼擅长间谍工作，通常与食指与中指级的盗贼合作，收集信息、阅读并记忆卷轴的内容而不直接偷取，并在其他人执行任务的时候担当望风及打掩护的角色。小拇指是规模最大，同时最低的等级。这1000名盗贼都是些不甚专精的成员：他们通常负责埋葬被害者（也包括暴风城刺客团成员），隐藏尸体，以及伪造作案现场。他们的职责是确保暴风城刺客的身份不被发觉。同时他们也要负责招新工作。