我觉得evaq说得还是很明白的，一群人分成了三派，碇司令有自己的计划，而碇真嗣只是一个没有大脑的小孩，葛成分立自成一派，到底是谁在援救世界表达不清。
还有就是那什么以初号机为动力的飞船，实在是没有意义的剧情。