九亭镇于1978年始建镇,名字来源于清代当地一个湖旁观景的著名亭子。九亭得名于公元1877年(光绪3年)仕人沈梦虎在泗泾镇与七宝镇全程十八里之中建造凉亭一座而得名—九里亭。九亭是块古老的土地,据考古发现,距今约6000年,先民们就在九亭地区劳动生息。公元前221年,秦始皇统一中国,九亭属娄县南境。唐天宝十年(公元751年)九亭为华亭县华亭乡之中心地带。清末,九亭大部属泗泾区七宝乡,部分属陈家巷乡、莘庄乡和青浦县龙固区杜寅乡。民国期间,九亭行政区域迭有变更,民国3年(公元1914年)华、娄县合并为松江县,九亭的九里亭村及蒲汇塘以南地区属七宝乡;苍石桥、姚家角等九亭南沿地域属陈家巷乡;北场东南部分则属莘庄乡。民国18年(公元1929年)秋奉省令试行区制,九亭大部分地区属泗泾区,部分属莘庄区。民国26年至民国27年(公元1937年—1938年)九亭属日伪维新政府泗泾区所辖。民国31年(公元1942年)日伪“清乡”期间,九亭属松江县特别区。民国36年(公元1947年)4月九亭属集贤乡和存仁乡。 1949年5月13日九亭地区解放,九亭属松江县第一联合办事处中的泗泾乡、莘庄乡(部分)及青浦县龙固区部分。1954年3月,青浦县龙固区杜寅乡划入松江县泗泾区。1957年撤区并乡。九亭地区归属泗联乡和新桥乡。1958年9月,撤乡建人民公社,泗联乡改名为东方红人民公社(1959年4月改名为泗联人民公社),新桥乡改名为卫星人民公社(1959年4月改名为新桥公社)。1978年3月,由泗联、新桥公社划出部分大队组建九亭人民公社,从此九亭成为独立建置。1984年改设九亭乡,1993年8月,九亭撤乡建镇,称九亭镇,从此实行镇管村(居委会)的行政体制。