刻意突出了N，是暗指New吗？

《序》的故事时间一直都没有给出，而原本剧情中第三使徒（新剧场版中的第四使徒）袭击NERV是在2015年。在《序》一开始，海已经是红色的了，建筑破烂不堪，更奇怪的是还出现了巨大的白色人形图案，

而TV版的海还是蓝色的的，建筑物也完好。第三次冲击是发生在南极，所以第三新东京市海洋变红应该不是受三冲影响。有人猜测这和EOE有关，认为ROE是EOE之后的世界。我并不是非常赞同这个观点，在我看来这个白色巨人也许是莉莉丝。接下来马上转到第四使徒攻击第三新东京市，
所有使徒都能够产生光环。
美里把真嗣带到总部时出现的新的NERV标志，新旧NERV标志是通用的 ，两者出现次数都非常多，设计新标志的用意不明。
在指挥部里坐中间的那位UN长官和SEELE的基路议长很像，你们觉得呢。
真嗣来到初号机停机舱并和父亲见面，经过一段心理挣扎后决定驾驶初号机

这里有个BUG，大家注意仔细看，此时插入栓的接口是开启状态，接下来的镜头却又闭合了

而且后来在开启时接口的样子对不上
此外2、3两张图有许多细节和第一张对不上，是用了TV版的画面吗？NGE系列作品中所使用的画面全是重新制作，虽然有使用电视版的素材，但电视版的原画一幅也没有使用，八成是疏忽忘了更改了。

继续继续，先插一个

初号机迎战第四使徒，暴走虐杀之

战斗结束后碇司令SEELE进行对话，SEELE成员在NGE中变成了7位（SEELE的标志也是七只眼），对话中提到了非常关键的一个词，“莉莉丝契约”，契约的一部分内容是歼灭所有使徒，最终目的仍是完成人类补完计划
真嗣醒过来之后美里把真嗣接到了自己家里住，在此之前还去购物并眺望第三新东京市。在美里在房间里换衣服我暂停了一下（我绝对不是变态！），结果发现美里的房间里有《君主论》和《韩非子》这两本书。

模拟战斗系统，原来插入栓的位置是这样子，由此可以推断插入栓顶端和EVA核心靠得非常近，也许就是靠在一起的。

之后迎战第五使徒，险胜，以此为契机真嗣获得了铃原和健介的理解，但和美里闹翻，离家出走最后还是被找到了。
在酒吧里律子说忘记把新卡给他们了，前面碇源渡提到要增加真嗣和丽的接触，这里估计是律子接受命令后故意而为之原NERV的标志下的彩色图案是什么？

真嗣拿着新卡“拜访”了丽，不久后第六使徒攻击本部，重头戏！
第六使徒能把自己的核心分成四个较小的核心，或许能解释Q中全身核心型的12号使徒以及Mark.09的一些疑问。

我插

初号机被强制回收后，美里针对第六使徒制定“屋岛作战”，一切准备就绪后就等真嗣驾驶，不过真嗣又发牢骚了，“总是躲在安全的地下本部发号施令，只有我担惊受怕。”美里犹豫了一下后带真嗣去了中央教条，新剧场版中美里已经知道中央教条里的是莉莉丝，并且有权限进入

最后一层门背后有SEELE的标志，不过从美里的方向是看不到的，那么也就是说莉莉丝是由SEELE封印的，要是美里看到背面SEELE的标志会是什么表情，此时美里以说是对SEELE一无所知。

朗枪已被插上，莉莉丝胸部还有伤痕

面具不是SEELE的七目面具，好像没有眼珠啊，跟Q中的巨大头颅对应吗。

在战斗中真嗣为了拯救凌波枪术爆发打败六号使徒，最后获得神级奖励，“女神的微笑”

接下来转入最后的剧情，

渚薰出现的地方共有9个箱子，前面已经开了4个，渚薰出现在第五个，注意这个细节，后面会再提到。有人根据月球上这条血线猜测NGE是EOE后的世界，不过看来看去这条血线也太细了吧，EOE里是这样的