Cain一直坠落到地表，几百年后才从灰烬中重生。他复活后立刻建立了“蔷薇十字骑士团”（其内部的位阶制见附录），暗中继续实现毁灭世界的野心。但这场事件也对他造成了严重的后遗症，使他的身体结构一直处于不稳定的状态（一不小心就解体），必须定时靠伊萨克的技术修复自己的身体，所以他的活动时间其实是很有限的。伊萨克之所以位居9=2高阶，不仅是因为他的力量最强，更重要的是他担负着维护Cain身体的任务，这一点也是骑士团内的至高机密。  

   

而Abel，则带着Lilith的遗体离开了方舟，到了米兰的一个地下墓穴中，在那里万念俱灰的他陪伴Lilith一起陷入了沉睡。直到900年后（公元3050年），复活的Cain命骑士团到处寻找弟弟的踪迹，想杀死他并把02的力量据为己有。当他终于找到Abel的藏身之所时，杀戮了当地的所有人（包括丝弗扎家族）。当时年仅14岁，在大学攻读法律的天才少女卡特琳娜·丝弗扎在逃命中闯入了地下墓穴，苏醒的Abel消灭了骑士团的人，救了她一命……Abel发誓继承亡友的遗志，决定和卡特琳娜一起守护人类。次年，Abel和卡特琳娜转入神学系，踏上加入教皇厅的道路。Abel成为了神父，帮助卡特琳娜成立AX（其组成见附录）。卡特琳娜升至枢机卿之位后，就带领AX与暗中威胁世界和平的势力展开了战斗。但作为派遣执行官德Abel自我封存了自身的很多力量，尽可能地不去伤害任何人，试图以乐观的态度去面对无尽的赎罪之途……   

   

至于seth，在两个哥哥失踪后，仅凭一己之力显然不足以取得对残存者的胜利，而且被改造过的归还者繁殖力非常低下，战争使人口锐减，于是她与教廷达成了和解，“长生种”与“短生种”的战争暂时告一段落。Seth建立了占据了欧洲的半壁江山的真人类帝国，实践她“用和平方式统治人类”的政治观。其实，Seth是一个极端理想主义者，她对残存者是完全失望的，因此一直希望建立一个“长生种”统治“短生种”的世界，将“短生种”像顺从的奴仆那样管理着，因此她也并不支持虐杀“短生种”的极端行为。但是，Cain复活后，帝国同样不可避免地成为骑士团的眼中钉。