NAMD是由伊利诺伊大学香槟分校的Klaus Schulten教授领导的理论与计算生物物理(TCBG)研究组为高效的模拟大的生物分子体系而开发的并行分子动力学计算代码.它最大可用200,000个核进行计算,可以在各种平台(Mac,Linux,Windows等)上安装运行. 引自 http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/
概述NAMD(NAnoscale Molecular Dynamics)是用于在大规模并行计算机上快速模拟大分子体系的并行分子动力学代码.NAMD用经验力场,如Amber,CHARMM和Dreiding,通过数值求解运动方程计算原子轨迹. 1. 软件所能模拟的体系的尺度,如微观,介观或跨尺度等 微观以及介观. 是众多md 软件中并行处理最好的...
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