首先理解一下什么是“母体”？
母体就是由我们控制的或者已经控制了世界的一台超级计算机！
什么是“史密斯”？
史密斯就是最开始母体中安装的正式版的杀毒软件（也可理解为卡巴斯基）。
什么是“neo”？
neo就是一个带有实验性质的软件，也可以理解为母体为了测试系统自身是否安全而写的一个程序。用neo这个程序来测试正式版的杀毒软件是否能真正有效的防护整个系统安全有效的运行。
什么是“zion”？
zion就是一个小的测试系统（neo软件开发环境），通过网络可以有限的、可控制的和母体通讯。
neo最开始被定义为“救世主”，why？因为母体发现已经安装的杀毒软件不能有效的保证系统的安全，所以母体就开发了一个新的杀毒软件--neo！
但是母体用“史密斯”软件已经很多年了，实在是舍不得删除它。就好像我们那些年用卡巴斯基一样一样的。所以母体最开始就安装两个杀毒软件在系统里。后来发现两个软件有冲突，不能装在一起。所以分别对史密斯软件和neo软件进行了升级，希望两个软件能相安无事，共同维护系统的安全。
第二集一开始，史密斯软件就表现出了一些不稳定的因素--开始误杀系统文件，造成整个系统的不稳定。而此时母体因为怕造成更大的面积的损失，所以不敢再运行其他的软件。唯一敢运行的就是neo这个软件。neo在这个时候表现出了不俗的自我防护能力，并且能保护其他软件不被误杀。但是母体到现在还没有放弃史密斯软件，希望能再次对其升级，改善其误杀系统文件的BUG。所以在第二集结束的时候，母体果断的卸载了neo，留下了史密斯。
第三集的史密斯软件因为母体对其升级后，变得更加的犀利和不可控。不仅没有了杀毒软件的功能，而且表现出了病毒的特性！只要是在运行的文件，都可以被他感染。
母体经过激烈的斗争之后(neo到机械城于母体谈判，其实就是母体自身在做激烈的思想斗争——到底是留史密斯呢还是启用新的杀毒软件neo？)。最后，母体还是卸载了史密斯，然后进行数据库倒档，恢复了先前的数据后，安装了新的杀毒软件——neo！
有了上面的框架思想，导演加入了各种人类社会的一些现象，以拟人的方式（什么救世，困惑，道德，正义，险恶，伦理，牺牲，合作，个人英雄主义等等）将一个新旧杀毒软件更替的过程以电影的方式表达出来而已！！
最后猜想：原稿作者可能就是在给自己的电脑换杀毒软件的时候有的这个剧本的写作灵感！
母体就是由我们控制的或者已经控制了世界的一台超级计算机！
什么是“史密斯”？
史密斯就是最开始母体中安装的正式版的杀毒软件（也可理解为卡巴斯基）。
什么是“neo”？
neo就是一个带有实验性质的软件，也可以理解为母体为了测试系统自身是否安全而写的一个程序。用neo这个程序来测试正式版的杀毒软件是否能真正有效的防护整个系统安全有效的运行。
什么是“zion”？
zion就是一个小的测试系统（neo软件开发环境），通过网络可以有限的、可控制的和母体通讯。
neo最开始被定义为“救世主”，why？因为母体发现已经安装的杀毒软件不能有效的保证系统的安全，所以母体就开发了一个新的杀毒软件--neo！
但是母体用“史密斯”软件已经很多年了，实在是舍不得删除它。就好像我们那些年用卡巴斯基一样一样的。所以母体最开始就安装两个杀毒软件在系统里。后来发现两个软件有冲突，不能装在一起。所以分别对史密斯软件和neo软件进行了升级，希望两个软件能相安无事，共同维护系统的安全。
第二集一开始，史密斯软件就表现出了一些不稳定的因素--开始误杀系统文件，造成整个系统的不稳定。而此时母体因为怕造成更大的面积的损失，所以不敢再运行其他的软件。唯一敢运行的就是neo这个软件。neo在这个时候表现出了不俗的自我防护能力，并且能保护其他软件不被误杀。但是母体到现在还没有放弃史密斯软件，希望能再次对其升级，改善其误杀系统文件的BUG。所以在第二集结束的时候，母体果断的卸载了neo，留下了史密斯。
第三集的史密斯软件因为母体对其升级后，变得更加的犀利和不可控。不仅没有了杀毒软件的功能，而且表现出了病毒的特性！只要是在运行的文件，都可以被他感染。
母体经过激烈的斗争之后(neo到机械城于母体谈判，其实就是母体自身在做激烈的思想斗争——到底是留史密斯呢还是启用新的杀毒软件neo？)。最后，母体还是卸载了史密斯，然后进行数据库倒档，恢复了先前的数据后，安装了新的杀毒软件——neo！
有了上面的框架思想，导演加入了各种人类社会的一些现象，以拟人的方式（什么救世，困惑，道德，正义，险恶，伦理，牺牲，合作，个人英雄主义等等）将一个新旧杀毒软件更替的过程以电影的方式表达出来而已！！
最后猜想：原稿作者可能就是在给自己的电脑换杀毒软件的时候有的这个剧本的写作灵感！
