条件性基因敲除主要是通过染色体位点特异性重组酶系统Cre-LoxP和 FLP-frt来实现的。想达到的目的是只有某个组织或者某个时间内，该基因条件性地敲除不表达，而在其他组织和时间内都是正常表达的。如果得到F1代杂合子小鼠后，直接和组织特异性Cre小鼠交配，那么就实现了特异的组织中该基因的敲除，其它组织中该基因仍含有Loxp和Neo，不能精确地模拟野生型，Neo的引进也可能引起一些表型，以干扰实验结果。