外伤。外伤性溃疡占所有口腔溃疡的最大比率。常见的成因是被牙齿咬伤，特别是排列不整齐的牙齿最容易发生这种现象。这类溃疡，只要去除引起外伤的原因，伤口一般在一个星期内会愈合。在治疗上，患者可涂止痛药膏或以药水涂抹患处，防止感染。
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鹅口疮。就是一般人常说的火气大，或睡眠不足引起的口腔破皮。它的发生率仅次于外伤性溃疡。临床常表现为反复性、多发性，就是重复出现，及同时几处溃疡，而且非常疼痛。鹅口疮的溃疡表面平坦，周围有一圈红晕。
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口腔癌。引起溃疡的口腔癌除了以肿块形式出现外，也可能出现口腔溃疡。可是这类溃疡，周围常会出现硬化边缘，而且溃疡中心的组织，会呈现疣状或菜花状的表面。
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放射线或化学治疗。头部或颈部因癌症而接受放射性治疗，或者化疗期间，正常的口腔黏膜细胞也会因放射线或药物的伤害、白血球数目降低，而产生全口广泛性的溃疡。严重时，患者会经验吞咽疼痛困难，甚至需要靠鼻胃管进食。
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其他原因。引起口腔溃疡的其他原因，包括糜烂型口腔扁平苔藓、天疱疮等自体免疫性疾病，或病毒、真菌感染，以及药物毒性反应引起的steven-johnson症候群等，不过后者是较为少见的情况。
