半索动物
黄岛长吻虫分类学上隶属于半索动物。半索动物的主要特征具有背神经索,其最前端变为内部有空腔的管状神经束,一般认为这是背神经管的雏形。消化管的前端有鳃裂,为进行呼吸的器官。口腔背面向前伸出一条短盲管,是一个很小的结构,称为“口索”,是半索动物所特有的,因此也称为口索动物或隐索动物。关于口索的作用尚无定论,有人认为它就是最初出现的脊索,也有人认为它相当于未来的脑垂体前叶。
关于半索动物在动物界究竟处于一个什么地位直到现在还有争论。有人认为半索动物应该列入动物界中最高等的一个门即脊索动物门中,是最原始的脊索动物类群。因为它的主要特征与脊索动物的主要特征基本符合。它的口索相当于脊索动物的脊索,它的背神经索前端有空隙,相当于脊索动物的背神经管,它也有咽鳃裂。
不同意这一观点的人则认为,把口索直接看成是与脊索相当的构造还缺乏足够的证据,因为根据一些研究报告,口索也很可能是一种内分泌器官。在另一方面,半索动物尚具有许多非脊索动物的结构,如腹神经管、开放式循环、肛门位于身体的末端等。
因此,都将半索动物列为一个独立的类群,作为非脊索动物和脊索动物之间的一种过渡类型。