飞船核动力系统工作原理如下，核裂变和聚变释放出的高能射线被媒介吸收，转化为高能离子，在磁约束下共同向一个方向喷出，形成强大的反冲作用。要形成强大的引擎有两个前提条件，核能可控可持续的强烈释放，释放出来的高能射线被媒介充分吸收。媒介可以是空气，水等物质。
核裂变要简单，可以用普通的方法，也可以用撞击的方法，后者可控性和可持续性更佳，核聚变就只能用撞击的方法。如果用撞击的方法，那么飞船的样子最好就是飞碟的模样，方便粒子加速。