麝香鼠种群组建核心群的数量：有研究表明，种群的数量占整个群体的10％左右最为适宜。种群麝香鼠选择的基本标准是：
种公麝香鼠选留要求品种特征明显，体型结构优秀，生殖系统发育正常，毛色正，性欲好，根据测定评估数据和现场观察及记录来决定。最后进入核心群的种公麝香鼠必须是经过生产性能测定过的种麝香鼠，选择该血缘最优秀的种公麝香鼠，加速麝香鼠群的整体遗传进展。种母麝香鼠选留要求品种特征明显，肢体结构优秀体长，生殖系统发育正常，奶头数量多，并排列整齐，发育良好，根据测定评估数据和现场观察来决定。核心群母麝香鼠：应该整理分析整个育种场母麝香鼠的产仔性状，在进行统计分析后，只有那些产仔数在麝香鼠群整体平均数一倍标准差以上的种麝香鼠才有机会进入核心群。无论种公麝香鼠或者种母麝香鼠，都要在同一血缘内比较后，选择最优秀者留种，种公麝香鼠尤其要经过测定比较后才能决定选留。
　　种群的更替核心群的管理应该是一个动态的、平衡的系统，对于这个系统既要是动态的，又要有一定的稳定性。每经过一段时间，利用遗传评估软件对整个麝香鼠群进行一次系统的评估，按照选择的指数对种麝香鼠进行一次评估，再根据实际生产中的具体表现，决定哪些种麝香鼠应该进入核心群，哪些种麝香鼠应该离开核心群，使整个核心群的生产性能总保持较高的状态，这样可为后备种麝香鼠的选择打下坚实的基础