1、与电疗混淆
经络生物电疗法是理疗的一种，而目前临床上应用的电疗仪被称为理疗仪，没有副作用，但是，由于理疗仪的疗效一直不是被广泛认可。因此，无论是患者，还是医学工作者，他们都将经络生物电疗法与普通电疗、理疗混淆，产生疑问。临床上应用的中频脉冲电疗仪的设计原理（详见本章第四节）与经络生物电疗法应用的生物电共振仪完全不同。
2、疑难杂症无法救治
无论是西医还是中医学者都认为疑难杂症是不治之症。因此，当经络生物电疗法开始治疗这些疑难杂症时，不管是患者，还是医学工作者都是抱有疑问的心态。