航海系的航海技术专业是江苏省高职示范专业、江苏省高职品牌专业、国家骨干院校重点建设专业。该系师资力量雄厚，拥有一支专兼职结合，学历、职称结构合理的师资队伍，拥有江苏省高等学校优秀教学团队1个、全国交通职业教育专业带头人1名、江苏省高等学校教学名师1名，远洋船长11名，专任教师中高级专业技术职务人员比例为43%，绝大多数教师具有丰富的航海实践经验。建有省级实训基地——海洋船舶驾驶实训基地，在省内外30多家航运企业建立了校外实训基地， 办学条件处于国内同类航海院校的领先水平。教育教学成果丰硕，获江苏省高等教育教学成果一等奖3项、二等奖1项，建有国家级精品课程、江苏省高等学校精品课程和江苏省高等学校优秀课程群。该系对学生实施半军事化管理和“双向四段”工学结合人才培养模式，学生可获得学历证书和国家海事局颁发、国际海事组织认可、国际通用的海船高级船员专项培训合格证书和适任证书。
该系为国家培养和输送了大量的航海技术人才，他们中的许多人已成为国内外远洋运输事业的骨干力量，毕业生已连续多年出现供不应求的喜人局面。