苦咸水淡化和海水淡化过程均是世界上常用的生产淡化水的成熟技术。水源地离海洋或海边越远，水的盐度越低，生产淡化水所需要克服的渗透压越低。这是苦咸水淡化经常被认为比海水淡化成本低的主要原因之一。
然而，从一些项目来看，海水淡化与苦咸水淡化相比更有利，并且成本更低。我们需要正确比较两种淡化技术的所有主要方面，以便确定最好和最合适的淡化技术。尽管苦咸水有较低的给谁TDS，但在处置浓水方面却更有挑战性。尽管苦咸水淡化需要更少的能量克服渗透压，但苦咸水淡化的水井取水通常比海水淡化的开放式取水需要更多的能量。另一方面是苦咸水井水的温度可能比大洋海水的温度低，使海水淡化在能量需求方面具有优势。
对比苦咸水和海水淡化，要评估的主要方面如下：
1）相对于主要淡化水用户的海水和苦咸水淡化厂选址
2）进水和产水的输送成本（泵送和处置）
3）海水淡化厂可能与使用海水作为冷却或其它目的的大型工业用户（如电厂）共建：
4）以主要矿物质和污染物含量的苦咸水和海水的产水质量；
5）可持续的水源，苦咸水水井的容量和深度、土壤的类型；
6）产生的浓水处理的技术和经济问题；
7）苦咸水和海水淡化的允许过程成本；
8）苦咸水和海水淡化处理过程的经济性：投资成本、运行与维护费用、生命期成和总产水成本