由于《仙剑奇侠传2》的失利,使得2003年7月推出的《仙剑奇侠传3》背负着振兴“仙剑”品牌的使命。制作方在游戏中加入3D元素,并且重回感动的剧情,并且在细节上做足了功夫,剧情丰满以及人物刻画都更深刻,最终挽救了仙剑这块金字招牌。《仙剑奇侠传3》也被评为2003年最佳RPG游戏。
《仙剑奇侠传三》故事发生在《仙剑1》的五十年前,主角是一名当铺伙计景天,前世是神界神将飞蓬,与对手重楼惺惺相惜。该作首次采用好感度来决定游戏的结局的,假如玩家努力练级的话,能够击败重楼就可以出现完美结局。
更为重要的是,它跳出了《仙剑奇侠传》的框架,从这一代开始游戏跟仙剑一已经没有太多的关系了,从这一代开始策划人员可以发挥自己的想象力,想象出任意的空间设定和世界观。