中华民国国务院，是中华民国辛亥革命时期和北洋政府时期的最高行政机关。以国务总理为首长。
1912年4月20日，始设国务院。1915年（民国四年）5月1日，袁世凯为集中总统权力，改《中华民国约法》，废除国务院，设政事堂，废除国务总理，设国务卿。政事堂附属总统府，不再是独立行政权力机关。1917年5月8日，恢复国务院建制。第二次直奉战争后，段祺瑞在1925年（民国十四年）11月24日任临时执政，集总统、国务总理权力于一身，废国务院与国务总理，1925年12月26日复设。张作霖于1928年（民国十七年）6月18日建立中华民国军政府，自任中华民国安国海陆军大元帅，也设置国务院与国务总理。
历届国务院均以秘书厅为办事机构，秘书厅设秘书长，下分若干课。国务院所辖各部：南京临时政府有陆军、海军、司法、外交、财政、内务、教育、实业、交通九部。迁都北京后，国务院设外交、内务、财政、陆军、海军、司法、教育、农林、工商、交通十部，后撤销农林部、工商部，设农商部。中华民国军政府时，设外交、军事、内务、财政、司法、教育、实业、农工、交通九部。