忍者300采用的发动机，总体来看，还是针对忍者250发动机改造后的产物。气缸直径由41.2mm扩展到48mm，采取了更轻、更短和强度更高连杆和活塞，从而应对更强的动力输出，该发动机的最高转速，仍维持在13,000rpm，与250相同

除了[url]http://发动机排量[/url]更大之外，在美国版小忍者上终于采用了电喷系统。同时，由于250发动机的离合片无法匹配300发动机，因此采用了FCC公司的全新离合器，该离合器表现效果更优，无疑会得到很多新老车手的赏识。虽然250发动机和300发动机从外观上看起来大致相当。但其内部45%的零部件都是新的。

忍者300最大的亮点就在于可以选配ABS。其使用的日清ABS装置，重量仅631克，这比日清之前的所有产品都轻60%。川崎甚至声称，这是在目前任何在产摩托车上最轻和最小的ABS

忍者300采用了140/70-17的后轮，同时，飞轮齿数减少了三个，而链条长度仍维持不变，轴距则比250增长了约5mm。设计上，忍者300也借鉴了ZX-6R和ZX-10R的设计，取消了原来的单前灯，取而代之的双大灯设计。整流罩和油箱都进行了轻微改变，尾部也变得更为苗条。

在忍者300上，川崎在巧妙地设计了双储藏室。打开鞍座，首先看到的是一个可容纳一盒香烟的小储藏室，翻转过来，则是一个可放工具包和其他物品的大储藏室，极为人性化。在牛摩网看来，这个设计，非常类似于宗申Z-one的理念。

忍者300独特的空气管理系统(KAMS)，可以将来自发动机的热量传导至地面，而不是通过直接在发动机周围散发，这样，在等待红灯的过程中，车手也不会因为发动机散发的热量而感到闷热。