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2.【吐槽】文和乱武(709395973) 21:21:22
@Sobereva 加上noeigentest的意思是在优化过程中不必每步都去检测虚频个数，而是按照最可能的方式继续寻找下去，到跑完为止，所以如果你对过渡态的初始构型不是非常有把握的情况下，加上noeigen是比较不错的选择。
【吐槽】文和乱武(709395973) 21:22:29
意思就是不用每一步都检查虚频？又学到东西了。谢谢@Sobereva
【传说】Sobereva(190258442) 21:22:55
对
3:
3. CoulSu: requested number of processors reduced to: 1 ShMem 1 Linda 的原理
http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=2199071
gaussian说明书中提到计算效率的时候有说明各个计算任务所需内存大小的估算
普通计算过程如L401，L502等计算所需内存一般仅有几十兆或几百兆就可以了 当然体系大些所需内存也会相应增加 与basis set成二次方
如果指定的内存很大，计算任务用不了那么大，就会有很多空闲内存。系统需要去处理一下去选择多少内存合适。这样也会降低一些计算效率的。
当计算freq也就是在L1102进程中，对内存的需求比较大，有一个命令freqmem 可以帮你计算一个体系所需内存的大小，与开壳层闭壳层、basis set数目、原子数目、基组劈裂方式等有关。
另外串行和并行之间内存的需求也是不同的，如1nproc所需内存为1GB，2nproc则为1.75GB,有一个公式可以帮助大家估算并行的内存：Mem(n proc) = Mem (1 proc) *（0.75* n + 0.25）
因此，提交任务之前最好估算一下计算所需内存的估算值。这样才能保证较高的计算效率。
如果计算任务设定的内存小于所需内存，则在计算的时候就会被迫降低效率或是使用更大的硬盘来弥补内存的不足，内存最好不要小于计算所需最小值；
例如当内存不够用的时候，计算freq时常常出现
CoulSu: requested number of processors reduced to: 1 ShMem 1 Linda
这是gaussian进行了降低并行效率的处理。这个时候你会发现cpu的并行数目要小于你的设定值。
当物理内存或是硬盘不能满足所需内存的最小值时，就会报错停止计算，好像是出现Netrr Error。
回答者：
http://xiaoma541
[url]http://银虫[/url] (小有名气)
[url]http://应助: 0 (幼儿园)[/url]
[url]http://金币: 542.3[/url]
[url]http://红花: 1[/url]
[url]http://帖子: 206[/url]
在线: 29.3小时
虫号: 604652
注册: 2008-09-17
专业: 理论和计算化学
3. CoulSu: requested number of processors reduced to: 1 ShMem 1 Linda 的原理
http://emuch.net/bbs/viewthread.php?tid=2199071
gaussian说明书中提到计算效率的时候有说明各个计算任务所需内存大小的估算
普通计算过程如L401，L502等计算所需内存一般仅有几十兆或几百兆就可以了 当然体系大些所需内存也会相应增加 与basis set成二次方
如果指定的内存很大，计算任务用不了那么大，就会有很多空闲内存。系统需要去处理一下去选择多少内存合适。这样也会降低一些计算效率的。
当计算freq也就是在L1102进程中，对内存的需求比较大，有一个命令freqmem 可以帮你计算一个体系所需内存的大小，与开壳层闭壳层、basis set数目、原子数目、基组劈裂方式等有关。
另外串行和并行之间内存的需求也是不同的，如1nproc所需内存为1GB，2nproc则为1.75GB,有一个公式可以帮助大家估算并行的内存：Mem(n proc) = Mem (1 proc) *（0.75* n + 0.25）
因此，提交任务之前最好估算一下计算所需内存的估算值。这样才能保证较高的计算效率。
如果计算任务设定的内存小于所需内存，则在计算的时候就会被迫降低效率或是使用更大的硬盘来弥补内存的不足，内存最好不要小于计算所需最小值；
例如当内存不够用的时候，计算freq时常常出现
CoulSu: requested number of processors reduced to: 1 ShMem 1 Linda
这是gaussian进行了降低并行效率的处理。这个时候你会发现cpu的并行数目要小于你的设定值。
当物理内存或是硬盘不能满足所需内存的最小值时，就会报错停止计算，好像是出现Netrr Error。
回答者：
http://xiaoma541
[url]http://银虫[/url] (小有名气)
[url]http://应助: 0 (幼儿园)[/url]
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4:
【冒泡】暮然(37361795) 13:45:33
请教：binding energy 和 Interaction energy 是一回事吗
【冒泡】暮然(37361795) 13:45:45
在分子间的弱相互作用中
【传说】山坡下,有颗树(240087934) 13:47:53
有人说是一样的。 不过我认为是不一样的。。
【冒泡】暮然(37361795) 13:48:23
【冒泡】苹果 (625860457) 14:12:24
@暮然 不一样的。
【冒泡】苹果 (625860457) 14:14:29
一个是用复合物的能量减去复合物中单体结构的能量（相互作用能），一个是复合物的能量减去稳定单体的能量（结合能）
【冒泡】暮然(37361795) 13:45:33
请教：binding energy 和 Interaction energy 是一回事吗
【冒泡】暮然(37361795) 13:45:45
在分子间的弱相互作用中
【传说】山坡下,有颗树(240087934) 13:47:53
有人说是一样的。 不过我认为是不一样的。。
【冒泡】暮然(37361795) 13:48:23
【冒泡】苹果 (625860457) 14:12:24
@暮然 不一样的。
【冒泡】苹果 (625860457) 14:14:29
一个是用复合物的能量减去复合物中单体结构的能量（相互作用能），一个是复合物的能量减去稳定单体的能量（结合能）
5
6. pop=NBO 和pop=NPA 一样吗？
答： pop=NBO除了图中NLMO那步都做。pop=NPA只做到绿色虚线
好的，谢谢NLMO是什么？如果要把NLMO也做完，用什么关键词？@Sobereva
答： @627.51 pop=NLMO
6. pop=NBO 和pop=NPA 一样吗？
答： pop=NBO除了图中NLMO那步都做。pop=NPA只做到绿色虚线
好的，谢谢NLMO是什么？如果要把NLMO也做完，用什么关键词？@Sobereva
答： @627.51 pop=NLMO
少年
