1813年拿破仑重新接管军队的指挥，欧仁奉命指挥第五军和第十一军。在吕岑战役后，他被派回意大利负责指挥意大利和伊利里亚的军队。1814年法国本土受到威胁，欧仁继续坚守意大利并且阻击奥地利军队，并在当年2月的明乔战役获胜。当敌人承诺他只要背叛拿破仑就可以做意大利国王，他拒绝了他们的建议，保持了对继父的忠诚。拿破仑退位后，欧仁与奥地利将军贝勒格德签署了《斯基亚里诺-里齐诺停战协议》结束了双方在意大利的敌对状态。随后他将军队指挥权交给格雷尼尔将军，把总督的权力交给皮诺将军。
欧仁随后隐退到巴伐利亚与他的妻子的家族一起生活。1815年拿破仑从厄尔巴岛逃离并建立百日王朝，他要求欧仁回到法国支持他但是欧仁没有离开巴伐利亚，相反他听从他的岳父巴伐利亚国王马克西米利安-约瑟夫的建议，没有参加百日王朝。他把他的后半生都用在尝试帮助那些参加了拿破仑战争的法国士兵上，这使他陷入了困境，更不幸的是他在42岁时死于脑溢血。