第2步 2—3小时扩增DNA达到检测量
“虽然第一步提取了一些DNA，但是还不能达到我们实验需要的量，还要经过扩增。”苏德琦告诉记者，为了能达到检测需求的量，要把小试管放入一个叫做扩增仪的仪器。把试管放入扩增仪后，里边的DNA提取物将不断繁殖、分裂。在一般情况下，经过2-3个小时的扩增，DNA提取物的量就能达到检测量。达到一定检测量后就可以进行DNA检测、比对。记者看到，实验人员把装有刚提取出来的少量DNA放入新的试管中，再加入了2微升的DNA，2微升的蒸馏水，6微升的亲子鉴定试剂。加入这些东西和DNA混匀后，实验人员把小试管放入扩增仪中进行扩增。
“扩增的过程需要温度交换进行才能达到效果。”实验人员告诉记者，因为DNA是两条链，通过扩增可以把链给打开，这样一来，每条链和所需要的材料结合后就能不断繁殖、分裂。但要把链打开，还需要一种温度，结合时需要的又是另外一种温度，不同的过程需要不同的温度变化。
第3步 提取20个位点数据进行比对
“DNA扩增后，就开始进行位点比对了。”苏德琦称，这个过程需要将DNA放入到一个完全封闭的仪器中，把它固定在一个位置，然后设备会自动从试管中提取DNA提取物，然后自动选择DNA位点，分析染色体。在一般情况下，设备会自动提取16个位点，然后，系统自动将需要做亲子鉴定的两个样本进行自动比对。
记者在电脑上看到，有多组荧光DNA峰，像心电图一样，苏德琦告诉记者，现在看到的就是位点的比对，只要子女与父母任意一方的DNA峰对上，就算位点对上，概率99.99%以上则属亲子关系。
苏德琦告诉记者，简单的来说，根据遗传学原理，如果所有的位点遗传信息都能匹配成功，也就能大概说，这对父子或者母子是亲子关系。即便有一两个位点不能成功匹配，在一般情况下，也能作出否定的结论。因为每个人都会有两条染色体，一条是父亲给予的，另一条是母亲给予的。在同一个点位上也会出现两条相同的数值，一个数值来自母亲，另一个数值来自父亲。如果20个位点都是这样，基本上可以说属于亲生关系，如果孩子有的数值父亲和母亲的都没有，那么他们就很有可能不是亲子关系。
对于为何说即便所有的位点都能匹配，也只能大概说是亲生的，苏德琦说，这是因为在所有的位点信息都出来后，他们还要进行概率计算。
当计算出来的概率达到99.9999%以上就属于亲子关系。