求助：相似性替代矩阵中为什么没有残基与空位的比较？【计算生物学吧】_百度贴吧

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求助：相似性替代矩阵中为什么没有残基与空位的比较？

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如图是PAM250，问题来了：如果比较的是空位与残基，该怎么办？

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1楼2015-01-14 21:45回复

那就是罚分，如果是线性罚分，全给-4差不多。如果是仿射罚分，开空给-8，延空给-2差不多。具体数字并不绝对，看蛋白质序列长度等等具体情况来定

来自Android客户端2楼2015-07-08 06:52

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