值得注意的是，良性肿瘤与恶性肿瘤之间有时并无绝对界限，有些肿瘤的表现可介于两者之间，称为交界性肿瘤。例如膀胱乳头状瘤具有良性细胞形态，但容易复发，甚至转变成恶性肿瘤。良性肿瘤如血管瘤多无包膜，界限不清，切除后容易复发。良性肿瘤发生在某些重要器官也可引起严重后果，例如颅内良性肿瘤（脑膜瘤、星形胶质细胞瘤）可压迫脑组织，阻塞脑室系统，导致极大的危害；又如发生在心脏的间皮瘤，仅数毫米大小，但可引起心律失常而导致患者猝死。恶性肿瘤也并非预后都差，如皮肤基底细胞癌生长缓慢，几乎不发生转移，经治疗后能完全治愈。肿瘤的良恶性也非一成不变，有些良性肿瘤如不及时治疗，可转变为恶性肿瘤，例如结肠腺瘤可恶变为腺癌。偶尔，恶性肿瘤也可转变为良性肿瘤，例如儿童的一种恶性肿瘤——神经母细胞瘤可以转变为良性的节细胞神经瘤。