早在1830年代,活跃于加拿大中部的浸信会教徒一直倡议办学。直至1887年,参议员William McMaster离学校创始人世后将其遗产捐出,创办一所基督徒学府 (a Christian school of learning),而学校亦以其名字命名。校舍当时设在位于多伦多市的 McMaster Hall, 1890年投入运作,教授文科及伦理学,并于1894年首次颁发学位。直到1930年,在汉密尔顿市民、校友及安省魁省浸信会联会 (Baptist Convention of Ontario and Quebec) 成员的捐助下,校舍迁移至安大略湖西岸的汉密尔顿市。校园早期建筑物包括 University Hall,Edwards Hall,Wallingford Hall等。 而原本位于多伦多的校舍则变成现今的皇家音乐学院 (The Royal Conservatory of Music)。