尽管政府自二○○二年以来已不断作出努力， 但全中国只有三万一千名艾滋病患者（包括六百名儿童） 从国家的免费治疗项目，获得抗逆转录病毒治疗。在缺乏最新数据的情况下，实际的艾滋病感染人数可能正不断上升。

截至二○○七年七月，无国界医生在广西壮族自治区南宁市和湖北省襄樊市的项目，共有一千三百名艾滋病患者，其中近半数正接受抗逆转录病毒治疗。无国界医生除了提供免费的综合护理服务外，还提供自愿性保密艾滋病病毒测试、机会性感染治疗和社会心理辅导。无国界医生还倡议国家供应具质素的仿制药，包括固定剂量
复合制剂、儿童用药和第二线药物等。无国界医生将于二○○八年三月，把襄樊的艾滋病医疗项目移交卫生部门，正式结束此项为期五年的工作。

耐多药结核病也急需人道援助来应付。据估计， 中国有十五万名耐药性结核病患者。无国界医生正等待中央卫生部门批准，在吉林省延吉市开展耐药性结核病医疗项目，同时正在协商于内蒙古自治区赤峰市开展类似项目。

陕西省宝鸡市的援助街童项目已于二○○六年，移交给由无国界医生协助成立的一个当地非政府组织，无国界医生继续提供经济援助以支持该项目运作。