截止到2013年5月底，经日本法务省公认的可以接受外国人留学生的日本语教育机构共428所学校。这些学校原则上也同时获得财团法人日本语教育振兴协会的认可。这里主要指三类学校:
2-1真正意义上的日本语学校
除了“东京日语教育中心”和“大阪日语教育中心”是早年为日本外务省创办，而现在由独立行政法人日本留学生支援机构JASSO负责运营外，其余的语言学校均由学校法人、财团法人、社团法人、宗教法人、株式会社、任意团体和个人等创立的私立学校。大多数语言学校分为上午班和下午班的两部制，每天学习4小时，每周学习20小时。以前日本语学校的在留资格为“就学”签证，但从2010年7月以后，日本语学校的在留资格均变为“留学签证”。
2-2依日本学校教育法设立的专门学校中的日本语课程
这类学校其实也可以说是专门学校所经营的语言学校，数量同日语学校相比较少，教学内容和时间安排同日语学校基本一致。按日本有关规定，在留资格为“留学”签证。
2-3准备教育课程
日本文部省规定，自高中升入大学必须接受过12年教育，但有的国家如马来西亚等国的学制只有11年，因此来自这些国家的学生要想在日本考大学，就必须先在上述指定的语言学校中接受1年“准备教育课程”后才能报考。在教学中，不仅教授日语，还讲授文理科的基础科目。一般每天上课6小时，每周上课30小时。这些学校的教学设施都比较先进和完备，教学质量有保障，另外，学校还设有食堂和宿舍。当然这些学校的入学条件相对来说也比较高，目前，也有不少中国大陆学生在这些学校学习。