人们总是想象人类身体中的所有器官都是无菌的，但事实并非如此，有些器官司如人类的口腔；鼻腔；肠道和阴道等器官里面会寄生有各种微生物，女性的阴道属于外生殖道，与外界相通，健康女性的阴道分泌物中包含大约有1亿个细菌。这些细菌通常有需氧和厌氧菌之分，需氧菌中包含有乳酸杆菌，棒状杆菌，非溶血性链球菌等，厌氧菌包括消化链球菌，类杆菌等，此外，还寄生有支原体，真菌，病毒及寄生虫等。
女性阴道有这么多微生物寄生，然而通常它们在阴道内的生存和繁殖都处于一个动态平衡的状态下，不会导致疾病发生，其中乳酸杆菌的作用功不可没，它在阴道正常菌群中数量最大，它可以交阴道上皮细胞中的糖原分解成乳酸，使阴道呈弱酸环境，从而抑制其他细菌的生长。此外，部分乳酸杆菌还可以直接分泌过氧化氢，也起到抑制其他细菌生成的作用。