亲子鉴定方法各异，但是其基本原理都是相同的，都是根据孟德尔遗传学定律，运用现代生物技术，对被鉴定者进行特定DNA片段的提取和检测，就通过比对鉴定者之间多个基因位点上的遗传信息，并对结果进行相应的计算和分析，江苏亲子鉴定中心得出鉴定结论的过程。
　　以下是常规的取样方法：
　　1.血液样本采集法：在专业人员的帮助下，取2-3毫升抗凝血，装于EDTA 抗凝管中(不能使用肝素抗凝的抗凝管)，并做好标记。
　　2.血痕样本采集法：血痕可以取耳缘血或者指血，婴儿可以采集足跟血。客户由医护人员取指血，滴3-4滴指甲盖大小的血液于四层医用纱布上，自然晾干。也可自行在家中用消毒后的采血针(大头针)用同样方法采血。
　　3.口腔拭子采集法：在采集前，先用清水漱口。然后用消过毒的医用棉签，伸入口腔内，在口腔内侧脸颊粘膜处反复擦拭30下左右。取出棉签，放于干净处晾干。用同样的方法再采集两根，以备后用。
　　4.毛发采集法：采集毛发时要注意双手和头发的干净卫生。孩子未满五周岁时不建议使用毛发采集法。采集毛发时，用手抓住距离毛发根部四厘米左右的地方，用力拔下5-10根头发，毛发末端要可见到清晰的毛囊，即毛发根部的白色物质。不能使用自然脱落或者剪下来的毛发做鉴定。
　　5.胎儿羊水采集法：胎儿羊水采集建议在孕妇怀孕16周以后进行，胎儿羊水的采取均由专业妇产科医生在可视B超的监控下进行，且采取量十分微小，基本不会对胎儿的正常发育造成危害。用羊水进行DNA亲子鉴定的，需要提供母亲的样本作为对照。