造成辣椒苗子发育异常的原因，一是苗床上偏施氮肥，播种量大，间苗迟；二是底肥不足，干旱失水；三是低温遭致冻害；四是连阴雨时间长，未及时通风炼苗；五是久旱之后一次浇水过多，其生理失调。子叶正常生长是辣椒壮苗的标志，壮苗则是辣椒高产的基础。为了辣椒幼苗健壮生长，必须创造条件预防异常苗情发生。
防治措施：一要坚持营养钵育苗，营养土中有机肥应占70％，同时应适量施用过磷酸钙，每1000公斤营养土加入过磷酸钙1-2公斤；二要浇水见干见湿，大干大湿，小干小湿，晴天多浇，阴天少浇或不浇，升温多浇，降温喷施新高脂膜保温防病菌侵染。移栽时浇定根水，喷施新高脂膜缩短缓苗期，缓苗后浇一次促苗水；三要科学控温，棚温不宜低于15℃，高于35℃；四要适时排风采光炼苗，遇上连续阴雨，中午应快速排风，并使用光膜肥提高吸收光能。