智乃一觉醒来就发现自己被一群人绑架了,他们自称是干兔庵圣殿骑士,且知道智乃是刺客,要用智乃的DNA对古代的一些咖啡圣器进行探索,智乃无奈,只好进入一个叫animus的机器,来读取自己祖先的记忆,她很快读取到一位刺客大师智乃的记忆。智乃作为提比最信任的徒弟,带着心爱和理世去干兔庵取金苹果,没想到被为首的圣殿骑士头目千夜伏击,心爱和理世被杀死,结果还引来干兔庵攻击rabblt castle,智乃被降为低级刺客,从头开始学习,同时提比也要智乃刺杀隐藏的圣殿骑士,她一步步完成任务,在杀死千夜,摩卡以后,智乃发现这却是提比的意图,急忙赶回去,但这时候提比已经对金苹果有了研究,获得了强大的力量,智乃与其决斗,最终杀死提比,金苹果也就此被埋到rabbit castle的密室……回到现代,圣殿骑士已经初步得到了咖啡圣器的线索,而智乃也面临被处死的危机,同时她还学会鹰眼,对地面,墙壁上的血迹进行调查,原来在她之前已经有人被当做试验品,但不幸死亡

