【试验1】高纤维VS低纤维
在实验开始时，小鼠所吃的食物中富含纤维——这些纤维包括可供肠道微生物利用的糖类。
在持续饲喂4周时间后，研究人员将这些小鼠分为两个群落：其中一部分小鼠仍旧饲喂高纤维含量的食物，而另一部分则开始改用低纤维食谱。自此，在实验之初没有明显差异的小鼠肠道菌群，随着时间的进展慢慢出现了不同——要知道，“这些纤维是肠道内益生菌的主要食物来源。”索尔伯格说。又4周后，在维持高纤维素饮食的小鼠中，仅有11%左右的菌种数量发生了微小的变化。相比之下，在摄入低纤维素食物的小鼠肠道内，超过60%的菌种，数量减少超过75%之多。
一部分这样的变化是不可逆的。7周之后，全部小鼠恢复食用高纤维素含量的食物。然而，曾长期摄入低纤维素食物的小鼠，肠道菌群也无法完全复原。
【试验2】菌群的可遗传性
更引人注意的是，这样的不可逆变化还是可遗传的。
体内菌群丰度受到影响的小鼠，无法有效地将菌群传递给它的子女。随着时间的推移，它的后代体内的菌群丰度进一步降低。
在这场低纤维素饮食导致的灾难中，损失情况最为惨重的是拟杆菌（Bacteroidetes）属的细菌。在正常小鼠肠道内占据总量超过60%的这一大“家族”，在服用低纤维素食物的小鼠体内越来越少——到第4代小鼠体内，拟杆菌仅仅占了肠道微生物总数的20%，而这其中大部分细菌都具有代谢糖苷的能力。