因为电脑比较难搞，就不贴图了，在此会写出漫画话数，供各位自己细细品味。
大致上：
1.“黑”井和真“白”的名字相对，不知道是否有意为之。
本作的学生一概不标明姓氏和名，而黑井又是通过伪造文书进入学院的（8话），黑井是否是他瞎编乱造的身份不得而知。“黑井”可以当作姓氏（参见黑井濑奈，一动漫人物），但作为名字显得有点怪异。
因为真白和黑井似乎是在海外派遣计划中才变得亲近，因此不排除这是真姓氏的可能性。
2.学生需要通过嗑药强化能力。（2话第六页，特殊能力开放委员会的平板电脑上写道：薄木强化了能力，所以正在使用安定剂）
目前本作没有出现先天后天能力者的设定。
真白的暴走（能力上升↑）则是不需要安定剂增强出力的。
3.学生被严格地管理着。
①真白可能是特殊的存在：
目前只有她一个人会暴走。
而男主对她情有独钟。（在后面我会说。）
②海外派遣计划其实是小白鼠实验啦！大家都去死！
第1话就已经介绍，能力者无法代替军队，离实用还有极其长久的一段距离。明知如此还派到海外，不是别有用心是什么！？
第6话被mei军压制的黑井：“让我们玩的可真开心啊，你们这些老头子。”←黑井知道很多，推测是因为真白的特殊性，而他调查了真白。
第6话高层会谈，”mei军通过这次的回收行动测试了压制特殊能力学生的可行性”。压制学生的对策被秘密出卖给了同盟——而这是他们供给高级装备的条件。
③同②，新校长表示，会对展开能力开发的新项目。
④黑井于第7话表示，这所学校的教职员工都是“完美的监视员”。
⑤12话，专门给学生提供奇怪服务的店其实为了收集他们的遗传因子。

对黑井的分析：
1.特殊能力
7话24p，少年从小就“直觉”很好。他在语言、肢体动作和声音这些综合情报进行“共感”的能力比一般人敏感数倍。
这里不清楚是不是汉化组的问题，还是原作就是“共感”。
催眠他自称是后天学会的。
摘自百度：
共感觉，英文原名为「Synesthesia」乃心理学名词「共感觉」之意，是一种感觉混合的罕见心理症状。它会从一种型态的感官刺激，如听觉，引发另一种型态的感觉，例如视觉或味觉等。好比有人听到尖锐的高音，会看到红光，或是吃鸡肉时手感觉的形状是圆锥形。
而在1话30p，黑井提醒了差点踩雷的真白。黑井回答真白“为什么可以知道”时，答案被涂黑了。不排除他催眠了真白导致真白不会记住的可能性。
3话27p，黑井不提醒学生会副会长澄致命的子弹，而他拉住了真白。事后解释“可以看到恶意、闻到危险的恶臭”。
假设他是共感觉患者：
直觉很好，在察觉到危险的那一刻其它感觉会同时作用，所以产生了像预知一样的效果。
（漫画中还未出现的设定）假设他的敏锐其实是先天的能力：
可能里心理掌控一类的。催眠也属于这方面。我不觉得学会即时催眠是件很简单的事情。

真白明天更。希望可以得到一些其它观点。

顶，男主真是戳萌点。森山老师的人物不论男女都很美型。

技术贴半夜看完，楼主帅！ww

来发真白。
①真白是本作中唯一会暴走的存在，并且被上层想出了压制的对策，使用电击（也就是说她很可能是研究样本）。
②本人不知道自己有暴走的那一面。
我认为“不知道”分为两种：第一种是有意识，但被消除记忆；第二种是完全没有意识。因为黑井在7话十分认真地说真白不记得了，所以推测她被消除了暴走部分的记忆。下手的是黑井还是学校没说。
③催眠无效。
3话，真白与黑井对峙，黑井情急之下使用了可能会破坏人格的应急机制，但对真白只持续了很短的时间，毫无作用。
④一个大胆的推测：
真白的不协调在黑井看来就是动作、语言、表情不协调。明明视线紧张，但指尖的动作却表现着舒缓。
——如果真白拥有两重人格，或者她的本我、自我被人为分开了，这就很好说了。所以黑井才无法影响她的深层意识。
⑤大胆的推测2（这个可能性低于上一个）
十三话预告，新校长带来了新药。真白可能是实验样本，是试用者或者以她为模板制作的。
⑥一个大胆的推测3
真白是先天能力者。
这个太没根据了，原作完全不涉及，我只好放到最后。

以上是第一部分，真白的特殊之处。以下是真白的性格分析。
她其实是一个典型的角色，比如看着视杀人为游戏的黑井问“你到底是什么人”（这句话简直是喜闻乐见，太常用了）。
她没有上过战场，不能接受残酷的情境，朋友在海外派遣计划中都死了。
目前没有提及她的家庭背景，但感觉是个一般的地方，因为她太正常了。除去特殊能力，在这部漫画里简直格格不入。（不排除她的背景是被伪造的）
真白强化身体能力，打人的时候牙齿嵌入了手背，她哭了。
有保护同伴的意识。
她喜（憧）欢（憬）薄木会长，当然不如会长女友牡丹。她的注意力被抱着会长脑袋微笑的黑井吸走了。尽管薄木才几话领了便当，但真白听他命令脸红的样子，还是历历在目。
另外，真白可能之前就在特殊能力学校。7话，黑井看采访真白的新闻节目，她穿着和现在一样的校服。

因为漫画黑井视角比较多，所以真白心理活动很少。

感谢吧友@mammothmk3
主要人物的名字的确是跟和色有关。浅葱这个颜色大家肯定耳熟能详。就不赘述了。
水柿的确是一种颜色。我附上图。
黑井ー黒い，与“黑色的”同音。
真白不是一种和色名，但白色指的是雪。
牡丹既可以指植物，也可以指狩衣和服的配色，其余意思都在图上（我点开国语词典查了一下）。
澄、薄木都是没什么意思的，的确是炮灰的作风。

补充：新校长名叫绿青，也是和色。

分析一下立刻条理都变清晰，真感谢楼主费这么大功夫w。
薄木死时真白注意的是微笑的黑井，这一开始还真没注意到，可能真白没有多么喜欢薄木，只是少女心吧

一个更新。
刚刚看到有人说愿君勿死其实是横尾太郎的大坑游戏《龙背上的骑兵》结局E后传+《尼尔》前传。
那好吧我不得不说我都知道这两个游戏，没玩但看过实况。
结局E（摘自百度知道）：我有印象但是不一定记的准确，记得有个结局里是个大肚子的怪物么？后来那个小孩契约者冲上去到了封印了，最后结局是这个结局的补充，主角和怪物被一起封印结果穿越到了我们的世界的日本新宿，在那里有个小游戏，根据对方大怪物放出的光环颜色按键全对就过关，打败了怪物，然后一架战斗机飞来乘主角不备一个导弹把主角灭了，龙焦掉了，掉下来插在一作高楼尖顶上,飞行员报告上司：新宿上空不明生物已经干掉了，正体不明什么的。
↑龙来到新世界！！！！！！！！！！！！！日本哦！！！！！！！！！！！！！！！
所以是前传吧。
至于尼尔NIER：
《尼尔》的故事是发生在一千三百年后的未来，地球的科学和文明已经被彻底遗忘。你扮演一位自己命名的父亲，为了拯救罹患怪病的年轻女儿Yunah而不遗余力。笔者不便在这里透漏剧情，因为古怪和忧郁的游戏故事就是这款游戏的魅力之一。但是可以告诉玩家的是，笔者相当欣赏游戏的角色们，尤其是在进入故事末盘更是如此。
PS3游戏的背景描述为一个“瘟疫和怪物横行、到处是无尽黑夜的破碎世界”。
以上都摘自百科。
所以龙给我们的世界带来了什么能量？
尼尔则是愿君勿死的末路？

卧槽，原来这么黑吗？？？