发酵床圈舍机构差异建造主要包括圈舍通风(天窗、地窗、风机)情况，圈舍发酵床垫料池，圈舍水槽，食槽设置，圈舍围栏选材等。具体如下：
　　1、通风情况主要包括圈舍的天窗、地窗、风机等。设置天窗、地窗、风机的目的主要是增加圈舍内部空气流动，首先是排出发酵分解产生的气体，例如氨气;其次通风良好的发酵床可以保证粪便尿液分解后的水分被蒸发出去，保证发酵床的干燥不潮湿;另外通风良好的发酵床有助于在炎热的夏季进行圈舍散热，防止猪舍夏季温度过高。一般老圈舍顶部无动力风机和地窗都没有设置，所以圈舍顶部需要需要安装无动力风机，圈舍底部最好设置地窗。
　　2、发酵床垫料池的设置。垫料池铺设发酵床垫料区，是发酵床正常运行的发酵区域，金宝贝干撒式发酵床垫料养猪厚度需要50公分，养鸡厚度40公分，垫料以锯末为最优。发酵床垫料池是给菌种提供发酵分解粪便的环境保障，也是为菌种分解粪便提供必要的碳源，设置发酵床垫料池避免垫料外易，方便铺设垫料及后期翻倒。
　　3、圈舍水槽、食槽。金宝贝干撒式发酵床发怕湿不怕干，除粪便以外的水分禁止流入发酵床，所以老圈舍需在饮水器下建造导流槽：防止猪饮用水滴下来进入发酵床，而是顺着导流槽排出到圈舍外面。新建圈舍建议水槽、食槽全部设在一侧的水泥台上即可。食槽可以选择移动式的，也可以选择固定式的，直接砌在水泥台上。
　　4、圈舍围栏。圈舍围栏建议使用钢管铁栅栏材质，这样便于单个圈舍内通风及空气流动，也节省圈舍面积，且美观大方实用，尽可能地不使用砖墙。圈舍围栏高度一般高出发酵床床面80公分及以上为好。另外每个单圈面积根据母猪、种公猪、育肥猪、鸡等不同，需要进行调节;单圈面积养殖畜禽数量也需要很好地控制，防止养殖密度过大造成发酵床粪便过多，影响发酵床使用效果。http://www.hx8178.com