“祖师殿”供奉的“无量天尊”是“女娲娘娘”抑或是“真武祖师”的2种说法在浮邱山一直流传至今。
“无量天尊”是“女娲”
有关“祖师殿”的“祖师”的来历，有这样一种传说在浮邱山流传至今。当年“祖师”与南岳“圣帝”西来东土，“圣帝”听说浮邱山有48面峰，风光无限。但“祖师”先一步到此地，并坐下了浮邱山主峰，风光被占。因此“圣帝”去了衡山，占坐了南岳七十二座峰，成为南岳“圣帝”。“祖师”就留在浮邱山。
南岳有“圣帝殿”，建于祝融峰上，祝融见于“女娲补天”故事。祝融居南方，后人传记为执掌南方丙丁火的火神故称炎帝。《三皇补纪》云“炎帝以火名官，斫木为耒，樽木为耜，耒耜之用，以教万人始为耕种，故号神农氏。”炎帝即神农氏。炎帝在女娲时，为火官祝融为火神，因之祝融与炎帝是同一个人的不同名字。共工与祝融，为争帝位而战，就是共工与炎帝争帝位。炎帝死后葬于长沙即今日之炎陵县，南岳祝融峰上的“圣帝殿”就是为纪念炎帝而立，因之“圣帝”即为炎帝神号。这样与“圣帝”同来浮邱山的“祖师”，是与“圣帝”同时代的，“祖师”就是神农之母是指生前的“女娲”。
因之浮邱山南侧“穿天坳”有“炼补亭”，浮邱山为女娲补天之地，从而“祖师”的来历得到了证实。
“无量天尊”是“真武祖师”
现在浮邱寺的“祖师殿”供奉的为“玄天真武祖师”的神像
“真武祖师”是神话小说《北游记》所塑造的神，《北游记》乃《西游记》之后的效颦之作。其情节构思、思想内容及文字水平都无法与《西游记》相比，其流传不广，作者是明末清初人，在文学史上也没有它的地位。
明代还有一个“真武大帝”，那就是篡国夺权的明成祖朱棣
朱棣取得天下之后，有两大心病。一是建文帝失踪；二是道教之尊张三丰隐居在武当山不出山。朱棣修北京紫金城，妇孺皆知。与此同时还做了一件秘而不宣的事，那就是武当山造建了紫金观，观内立高大的尊神“真武大帝”，此乃自己的金身。传说建文帝从浮邱山失去了踪影，从此浮邱寺内的“祖师菩萨”就成为了“真武祖师菩萨”。这些与朱棣有什么关系有待考证。
由于永乐大帝“朱棣”为了体现自身的帝位是“皇权天授”，在其大力推行下，从明朝开始直到现在，使全国各地的“祖师殿”供奉的祖师为“真武祖师”。
“祖师殿”内设供奉的“无量天尊”是“真武祖师”的说法比“祖师殿”实际建造者潘子良晚了一千多年。