本人研二,211的生信专业,感觉生信目前太杂而且没有统一标准。拿学科来说,需要分子生物,数学,统计,计算机方面的知识背景,拿要掌握的技能来说,需要做过基础的分子生物学实验,生物化学实验,会linux,Python或R,java或c,如果做数据库还得懂html,css等动态网页编辑技术。需要了解很多数据库的数据,熟练使用主流牛逼数据库,UCSC我用的最好并力荐! 此乃神器!
现在比较热门的就是测序分析这一块了,我做完chip-seq,RNA-SEQ(polya测序),从原始数据clean到新基因预测到差异表达分析再到pathway,真心觉得不同程序跑出来的结果千差万别,中间没有标准化的流程与唯一的指标。又做了顺式调控元件的表观遗传分析,最烦恼的问题就是没有标准,你得自己定这个标准并做出解释。
生信是条需要广读文献的路,需要眼界从N个G的数据中提取出最有价值的数据,以前我以为生信需要的是编程能力,现在觉得生信需要的是理解基因组的大局观。
不把电脑系统翻来覆去装个10几遍根本入不了门。
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