以下是NavisWorks原生的文件格式：
NWF
NWF文件包含您正在使用的所有模型文件的索引。它还存储所有其它的NavisWorks®数据。例如，如果在NavisWorks中打开一个DGN文件，并向该文件添加Presenter素材（如视点和圈红线），则NWF文件将包含一个指向该DGN文件以及所添加的全部 Presenter素材的指针。
强烈建议您于处理正在进行的项目时使用NWF文件格式，因为这样对原始CAD图形所作的任何更新都将在下一次打开该模型时反映出来。
NWD
只有具备NavisWorks Publisher许可才能保存NWD文件。这种文件格式存储NWF文件格式存储的所有NavisWorks特定数据，外加模型的几何图形。NWD文件一般比原始的CAD文件更加紧凑，可以更快地载入到NavisWorks中。
这些文件将用于发布和分发当前项目的已编译版本，供其他人审阅。NWD文件的优势在于，即使其他用户没有NavisWorks，他们也可以通过使用NavisWorks的免费查看器Freedom来审阅这些文件。此外，也无须向其它用户发送所有的源图形，只须一个安全NWD文件即可。
NWC
NWC文件不作为一般用途使用。它包含模型几何图形经转换后的高速缓存版本。这种文件由NavisWorks导出程序创建，使用户能够将文件传递到NavisWorks中，以NWF或NWD文件格式保存。在Roamer中打开模型时也会创建这种文件，以便下次更快地载入模型。您不能自行另存为NWC文件格式。
NWP
NavisWorks Palette文件可以通过保存获得，或从Presenter载入。它包含一系列用户定义的纹理和素材。使用这种文件格式可以在项目之间传递素材。