锦鲤品种的划分主要依据其颜色分为若干品系。其鲤种来源分为绯鲤、革鲤和镜鲤。

锦鲤共分为九大品系，约百余品种。根据色彩、斑纹及鳞片的分布情况，主要分为13个品种类型。

1. 红白锦鲤：锦鲤的正宗，全体纯白底红斑，不夹带其它颜色，底应雪样纯白，红斑浓而均匀，边界清晰。本类型分为20多品种。

2. 大正三色锦鲤：白底上有红、黑斑纹，头部具红斑而无黑斑，胸鳍上有黑色条纹。此品系可分为10余品种。

3. 昭和三色锦鲤：黑底上有红、白花纹，胸鳍基部有黑斑。头部必有大形黑斑。此品系下分10余品种。

大正三色与昭和三色都是红、白、黑三色组成。其区别为：

大正三色为白底上有红、黑斑；昭和三色为黑底上有红、白斑。

大正三色头部无黑斑，而昭和三色有黑斑。

大正三色的黑斑呈圆形块状而存在于体上半部；昭和三色的黑斑呈线纹或带状，存在于全身。

大正三色的胸鳍全白或有黑条纹；昭和三色胸鳍基部有圆形黑斑块。

4. 乌鲤：全体黑色或黑底上有白斑或全黄斑纹。可分为4至5个品种。

5. 别光：白底、红底或黄底上有黑斑的锦鲤，属于大正三色品系。细分为近十品种。

6. 浅黄：背部呈浅蓝色或深蓝色，鳞片外缘呈白色，脸颊部、腹部及各鳍基部呈赤色。根据颜色分10余个品种。

7. 衣：系红白或三色与浅黄交配所产生的品种。细分为近10个品种。

8. 变种鲤：包括乌鲤、黄鲤、茶鲤、绿鲤等二十多个品种。

9. 黄金：全身清一色金黄，可分为二十余品种。

10. 花纹皮光鲤：黄金锦鲤与其它品系（不含乌鲤）交配产生的品种。常见有10余品种。

11. 光写：写类锦鲤与黄金锦鲤交配产生的品种。

12. 金银鳞：全身有金色或银色鳞片的锦鲤。

13. 丹顶：头顶有圆形红斑，而鱼身无红斑。