卵巢囊肿的手术，除了是剔除多余的囊肿外，有时候还需要对粘连在卵巢上的输卵管进行剥离，以免粘连在卵巢周围的输卵管影响到卵巢的正常排卵功能。
因此，手术过程中，第二大后遗症就是有可能会影响到卵巢、输卵管伞端的正常功能。