山东大学齐鲁医院不仅是山东大学的附属医院，承担着临床医学专业从本科到博士的教学任务，而且还是国家疑难重症的整疗中心之一，在国内外享有盛誉。2016年11月发布的《中国最佳医院综合排行榜》上跻身全国前20强，位居华东地区第三位，其中，医院神经外科、血液科、普外科等9大科室位列全国十强，其他多科室也获得十强提名。
神经外科
依托山东大学脑科学研究所和齐鲁医院的良好平台，神经外科先后曾获山东省科技奖励80余项，持有国家专利8项。自建科以来颅内肿瘤切除病例数量位居国内前列，常规手术死亡率已降至2%以下科室主任王志刚教授更是在颅内动脉瘤、脑动脉畸形等各种脑血管病的治疗上有着大量的临床经验。
普外科
山东大学齐鲁医院普外科中的胃肠外科率先将肠内和肠外营养应用到手术期中，改善病人手术前后营养状况，降低了手术并发症发生率。在科室主任何庆泗教授的带领下胃肠外科在科研和新技术的推动下科室有了长足的发展，并且本人对普外科疑难疾病治疗见解独到，尤其擅长胃肠道肿瘤的外科治疗。
血液科
血液科在特发性血小板减少性紫癜、白血病、再生障碍性贫血发病机理、特异诊断和治疗的研究方面传保持统优势领域，尤其是在科室主任袁成录的带领下开展的同基因自体、异基因、非血缘、单倍体相合、造血干细胞移植治疗技术，填补了山东省内多项领域空白。
除了榜上有名之外，山东大学齐鲁医院在近期由国家卫生计生委指导，健康报社与相关医学科研机构联手举办的“2017中国卫生与健康科技创新发展高峰论坛”上荣获“2016年度健康报最佳宣传团队奖”，成为省内唯一获此殊荣的医疗卫生单位。不仅如此，医院本着“博施济众”的医院精神，已与汇医在线平台达成合作协议开通官方视频问诊通道，方便全国患者预约问诊专家。