对于没有代谢组学研究背景的实验室来说，刚开始这方面的研究，首先需要根据自己的研究制定好方向。
包括：仪器平台，软件，数据库基本搜索。
目前，除了天然药物化学外，一般代谢组学研究，使用生物质谱正在成为主流。包括GC-MS和LC-MS。其中GC-MS通用性较为好一点，LC-MS中，UPLC-QTOF/MS主要使用做非靶向代谢组学使用，目前一些厂商也在宣传自己的QTOF/MS可以定量，但是不推荐使用。UPLC-MS/MS主要用来做靶向定量代谢组学。
软件的话，仪器厂商自带的软件基本可以满足使用，如果是非靶向代谢组学，需要考虑到数据处理和数据分析，一般来说使用R语言就可以完全满足数据分析的需求，但是R对于新手来说入门复杂一点。而SIMCAP和SPSS入手相对容易一点，其中SIMCAP目前被国内的某代理商代理了，价格较为啃爹，一般使用，推荐使用13.0破解版的就可以了，网上很多，SPSS也有。
数据库一般使用仪器厂商自带的加上公共数据库就可以了，另外建议多多阅读文献，选择与你的研究相近的已有文献多多阅读，看看别人是如何建立方法的。这里我无法给出具体的方法，因为代谢组学实验方法划分的比较细。只有选择相应的文献多家阅读才是事半功倍的正途。
谢谢。另外欢迎在我的帖子中跟帖留言交流代谢组学知识。

楼主，您好，能问你个问题吗？就是做代谢组学的时候怎么在matlab中加载plozh命令呢

10 mL of serum were loaded onto a inserted filter in a 96 well sandwich plate, which already contained appropriate internal standards structurally identical but labeled with stable isotopes such as deuterium, 13C, or 15N. 请问为什么要进行同位素的标记

做代谢组学，专家都会问一个问题，你检测的具体是指哪些东西，怎么检测，化验单怎么开，比如查粪常规，总归要列出具体有哪些项目，请问老师：回答測全部代谢物，别人不能接受怎么办

大佬好，我是想入门代谢组数据分析的大四学生。请问有哪些书籍或者资料推荐，可以自学代谢组学的基本原理和数据分析呢？

楼主好，我想问一下细胞样品，检测处理之后各种代谢物的变化，包含三大营养物质代谢的物质的非靶代谢组学。有的公司说做GC-MS,有的说要做LC-MS，我如何选择？

楼主，请问通过质谱仪测出的化学式，但不知的中英文名字，怎么办,如：C14H31N17O？

您好，我第一次接触代谢组，我的课题导师猜测可能和代谢物相关，所以我们测了一组植物的代谢物，非靶向，公司给了数据，但是不知道该怎么入手分析，请大佬赐教，另外，请问能加个微信深入交流吗

可以加微信详聊嘛 实在学不会

你好，大佬。我刚接触代谢组学，我想咨询关于代谢组学数据分析的问题，方便加微信吗？万分感谢

我想咨询，我做的是临床疾病血清样本，有多个质核比对应一个化合物，而且p都小于0.05，做热图时是随便选一个还是怎么选择？