全科信息系统还内置了“处方点评”，可根据BP提供的具体治疗方案及专家点评功能，实现对医生处方（医嘱）的电子化评价。当基层医生明确诊断后开具处方，系统将自动推送BP中的治疗方案为医生提供参考，并且自动识别医生所开处方与BP治疗方案的相似度。对与BP的治疗方案不一致的地方，由专家团队进行点评。如认定为合理处方且不是BP治疗方案里涉及的药物则将其加入BP的本地化内容里，如认为不合理则进行标记，并对医生的治疗方案提出改进意见。同时，系统还可以将这些评价结果进行信息化存储，以便对处方评价结果进行统计和分析，方便卫生监管部门对处方用药进行深入的分析、研究和管理，为提高医疗服务质量，节约医疗成本提供有效数据参考。处方点评还会对处方药品的配伍禁忌和过敏反应等提出预警，保障医生用药安全。